这是名为 Protospacer Workbench 的 Windows 应用程序,其最新版本可以下载为 Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并运行这个名为 Protospacer Workbench with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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原型间隔工作台
商品描述
Protospacer Workbench 有助于设计、分析和共享任何生物体或一组 FASTA 格式序列的 CRISPR 目标位点。CRISPR/Cas 基因组编辑系统的引导 RNA 设计直观上很容易,但在计算上却很困难。 主要困难来自需要识别可能与预期目标完全不同的潜在脱靶。 当前用于引导 RNA 设计的在线工具为诸如 Bowtie 或 BLAST 等序列映射软件提供了一个用户友好的界面。 然而,虽然速度很快,但这些映射算法的设计对错误的容忍度并不高,这是确定潜在脱靶的关键特征。 在线工具失败的地方,离线工具成功。 然而,离线工具需要命令行的知识,而很少有使用 CRISPR 的人拥有这些知识。 Protospacer Workbench 旨在弥合在线和离线引导 RNA 设计之间的差距。 该软件目前可用于 OS X,并将很快移植到其他操作系统。
特性
- 快速找到所有可用的 CRISPR 目标
- 彻底评估向导 RNA 设计
- 共享目标和指导 RNA 列表
- 为任何有机体设计
- 管理多个数据库
- 分步工作流程
- 获取有关预期向导 RNA 性能的报告
- 从一个界面使用多个第三方工具
- 多目标设计
- 管理大型目标/指导RNA列表
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。