هذا هو الأمر bp_download_query_genbankp الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
bp_download_query_genbank - برنامج نصي للاستعلام عن Genbank واسترداد السجلات
الاستعمال
bp_download_query_genbank --الاستعلام "Neurospora[ORGN]" --db nucest -o Ncrassa_ESTs.fa --تنسيق fasta
bp_download_query_genbank --queryfile 'filewithquery' --db nucest -o Ncrassa_ESTs.fa --format fasta
أخرى الخيارات
توفير واحد من:
-q - سلسلة استعلام الاستعلام أو
--queryfile ملف التعريف مع الاستعلام OR
--gi --gis --gifile ملف يحتوي على قائمة بالمعلومات الجغرافية المراد تنزيلها
نوع قاعدة البيانات:
-d --db قاعدة بيانات (النوكليوتيدات [افتراضي]، nucest، البروتين،)
-o --out --outfile ملف الإخراج (يتم عرض النتائج على الشاشة بخلاف ذلك)
-f - تنسيق إخراج ملف التسلسل (fasta افتراضيًا)
-v - إخراج التصحيح المطول
سؤال الخيارات
--maxids الحد الأقصى لعدد المعرفات التي يمكن استردادها في مجموعة (100 في المرة الواحدة بشكل افتراضي)
- قديم
--maxdate maxdate للتسجيل
--mindate الحد الأدنى لتاريخ التسجيل
--نوع التاريخ edat أو mdat (تم إدخاله أو تعديله)
AUTHOR جايسون ستاجيتش
جيسون ستاجيتش، jason-AT-bioperl.org
استخدم bp_download_query_genbankp عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
