هذا هو الأمر gdcmimg الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gdcmimg - معالجة ملف صورة DICOM.
gdcmimg هي أداة ذات مستوى منخفض للسماح بفك / تغليف من / إلى صورة DICOM. هذه الأداة تعمل
لا يفهم تحويل بناء الجملة. سيقوم بتغليف البيانات الأولية كما هي. هذا
له بعض التأثير في بعض الحالات ، انظر التحذيرات الخاصة أدناه.
من المهم ملاحظة أن gdcmimg يمكنه فقط تغليف ملف الإدخال الصحيح ، على سبيل المثال
يتم قبول JPG و أو JP2 حيث يمكن العثور على بنية نقل DICOM المرتبطة.
ومع ذلك ، فإن المدخلات مثل TIFF و / أو PNG ليست كذلك ، لأن DICOM لا يدعمها. يرى
بدلاً من ذلك ، أداة مثل gdcm2vtk.
موجز
gdcmimg [خيارات] إخراج ملف
الوصف
ال com.gdcmimg يمكن استخدام أداة سطر الأوامر في نسختين:
1. تحويل تنسيق ملف معترف به إلى نظيره DICOM المغلف ،
2. إخفاء هوية جزء مستطيل من ملف DICOM.
المعلمات
ملف إدخال اسم الملف (غير DICOM)
إخراج ملف DICOM اسم ملف الإخراج
OPTIONS
-i - إدخال اسم الملف
-o - إخراج اسم الملف
محدد OPTIONS
- Endianness٪ s (LSB / MSB).
-d - العمق٪ d العمق (إما 8/16/32 أو BitsAllocated على سبيل المثال 12 عند معرفة ذلك).
- قم بإشارة٪ s بكسل (0/1).
--spp٪ d نموذج لكل بكسل (1/3).
-s - الحجم٪ d ،٪ d الحجم.
-C --sop-class-uid فئة SOP UID (الاسم أو القيمة).
-T - معرف المستخدم الخاص بالدراسة.
-S --series-uid سلسلة UID.
- root-uid Root UID.
ملء OPTIONS
-R - منطقة٪ d ،٪ d منطقة.
-F - قم بتعبئة٪ d بقيمة البكسل المحددة.
يمكنك تحويل أي لحظة سعيدة إلى ذكرى ثمينة وخالدة – احتفظ بها على شكل صورة أو مقطع فيديو باستخدام الكاميرا الخلفية المضمنة. ومن خلال اتصال Bluetooth، يمكنك مشاركة الملفات ذات المحتوى العزيز على قلبك مع أجهزة المقربين منك. OPTIONS
ح- مساعدة
اطبع نص المساعدة واخرج
-v - الإصدار
طباعة معلومات الإصدار والخروج
-V - الإفراط في الكلام
الوضع المطول (تحذير + خطأ).
-W - تحذير
وضع التحذير ، طباعة معلومات التحذير
-E - خطأ
وضع الخطأ ، طباعة معلومات الخطأ
-د - الشطب
وضع التصحيح ، طباعة معلومات التصحيح
البيئة متغير
معرّف جذر GDCM_ROOT_UID
أيد FILE FORMAT (ملائم FILE امتداد)
gdcmimg ستؤسس عملية التحويل على أساس امتداد الملف. يتبع قائمة
معترف بها امتداد الملف. عندما لا يتم العثور على أي امتداد ، يتم افتراض ملف DICOM.
نمط الإدخال
* RAW (خام ، Rawl ، رمادي ، RGB)
* رل (رل)
* PNM (pgm ، pnm ، جزء في المليون)
* جبيغ-لس (جلس)
* JPEG 2000 (jp2 ، j2k ، j2c ، jpx ، jpc)
* JPEG (jpg ، jpeg ، ljpg ، ljpeg)
* ديكوم ()
تنسيق الإخراج:
* PGM (pgm ، pnm ، جزء في المليون)
* ديكوم ()
بالنسبة لتنسيق ملف RAW ، يجب أن تهتم بشكل خاص بالخيار –endian. لل (القديم)
تنسيق ملف JPEG ، يتم دعم كل من التنسيق المفقود وغير المنقوص ، ويجب على المستخدم الدفع
الانتباه إلى خيار التوقيع. بالنسبة لتنسيق الملف مثل RLE أو RAW ، من المتوقع أن يقوم المستخدم
املأ المعلومات المطلوبة للعثور على البعد ونوع بيانات الإدخال حيث لا يوجد
طريقة أخرى للعثور على هذه المعلومات. بالنسبة لجميع تنسيقات الملفات الأخرى ، يتم اشتقاق الخصائص
من تنسيق الملف نفسه.
من المفترض أن يكون ملف PNM كبير الحجم (مهم للعمق> 8)
TYPICAL الاستعمال
حذف a مستطيلي جزء of القادم صورة
لملء المنطقة [0,100،0,100] × [XNUMX،XNUMX] من صورة DICOM ، قم بما يلي:
$ gdcmimg - ملء 0 - منطقة 0,100,0,100،XNUMX،XNUMX،XNUMX -i input.dcm -o output_black.dcm
تحذير: إذا تم ضغط بيانات البكسل ، يتم فك ضغط الصورة أولاً بحيث يتم ضغط البكسل
يمكن ضبطه على 0 ، لكن لا يتم إعادة ضغطه.
تحول RAW إلى ديكوم
الامتداد المعترف به هو .raw أو .rawl أو .gray أو .rgb (غير حساس لحالة الأحرف)
gdcmimg $ - الحجم 512,512،16 - العمق XNUMX -i input.raw -o output.dcm
ستكون الصورة لقطة ثانوية.
عندما يكون الإدخال مكونًا من 3 مكونات ، يحتاج المرء إلى تحديد عينات لكل بكسل صراحة:
$ gdcmimg - الحجم 512,512،3 --spp XNUMX input_rgb.raw output_rgb.dcm
عندما يحتوي اسم الملف على .rgb كإخراج ملحق للملف يتم التعرف عليه تلقائيًا على أنه
RGB لا تحتاج إلى تحديد –spp
$ gdcmimg - بحجم 512,512،XNUMX إدخال. إخراج RGB_rgb.dcm
يمكنك استخدام dd cmd لتخطي أي رأس ترغب في تجاهله ، على سبيل المثال ، إذا
إذا كنت ترغب في تخطي أول 108 بايت ، فما عليك سوى القيام بما يلي:
$ dd تخطي = 108 bs = 1 if = input.raw of = output.raw
.raw و. امتداد الزحف متكافئين. تحتاج إلى تحديد مدى صراحة
يدويا:
$ gdcmimg - MSB هندية - الحجم 512,512،16 - عمق XNUMX - i input.raw -o output.dcm
or
$ gdcmimg - LSB الهندية - الحجم 512,512،16 - العمق XNUMX - i input.raw -o output.dcm
تحول PGM / PNM / جزء في المليون إلى ديكوم
الامتدادات التي تم التعرف عليها هي .pgm ، .pnm ، .ppm (غير حساسة لحالة الأحرف)
$ gdcmimg -i input.pgm -ooutput.dcm
ستكون الصورة لقطة ثانوية
تحول RLE إلى ديكوم
الامتداد المعترف به هو .rle (غير حساس لحالة الأحرف)
gdcmimg $ - الحجم 512,512،16 - العمق XNUMX -i input.rle -o output.dcm
ستكون الصورة لقطة ثانوية
تحول JPEG إلى ديكوم
الامتدادات المتعارف عليها هي .jpg و .jpeg و .ljpg و .ljpeg (غير حساسة لحالة الأحرف)
gdcmimg $ -i input.ljpeg -o output.dcm
ستكون الصورة لقطة ثانوية
تحول J2K إلى ديكوم
الامتدادات المتعارف عليها هي .j2k و. jp2 و .jpc و jpx و j2c (غير حساسة لحالة الأحرف)
$ gdcmimg -i input.j2k -ooutput.dcm
ستكون الصورة لقطة ثانوية.
سيتم اشتقاق جميع معلومات البكسل (Bits Stored / Allocated ...) من الصورة نفسها ،
وليس من خيارات سطر الأوامر.
تحديد a SOP الفئه UID
بدلاً من التخزين الافتراضي لصور الالتقاط الثانوي ، قد يرغب المرء في تحديد ، على سبيل المثال VL
تخزين الصور الفوتوغرافية.
gdcmimg $ - uid من الدرجة الأولى 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.77.1.4 input.jpg output.dcm
مضاعف FILES
gdcmimg يتعامل بشكل جيد مع مجموعة من الملفات (على سبيل المثال jpeg):
$ gdcmimg -C 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.12.1 1.jpg 2.jpg 3.jpg 4.jpg Output.dcm
من المهم تحديد فئة SOP التي تدعم الصور متعددة الإطارات بخلاف ذلك
ستفشل gdcmimg.
إبدأ الأوفست
في بعض الحالات ، قد يرغب المرء في إنشاء شريحة ثنائية الأبعاد من وحدة تخزين عشوائية (مثل ثلاثية الأبعاد). في
في أي حالة - يصبح الإزاحة في متناول اليد:
$ gdcmimg - إزاحة 4954104330 - الحجم 1673,1673،3 Input1673D_1673_1775_1770.raw slice_XNUMX.dcm
تحذير
هناك مشكلتان في تنفيذ gdcmimg:
بالنسبة لملف RAW ، يجب الانتباه إلى أنه عند استخدام –endian MSB ، ستكون بيانات البكسل كذلك
مغلف كما هو (لا يتطرق بواسطة gdcmimg). لذلك فإن صيغة النقل الوحيدة الممكنة
متاح هو ضمني VR Big Endian DLX (GE Private). GDCM تتعامل مع هذا الأمر الخاص
بناء الجملة. لذلك إذا كنت بحاجة إلى تحويل صيغة النقل هذه إلى صيغة أخرى (والسماح بتنسيق
معالجة بيانات البكسل) ، يمكنك استخدام:
$ gdcmconv --raw - فرض input_big_endian_dlx.raw -o output_implicit_vr_little_endian.dcm
بالنسبة لملف JFIF وملف JP2 (مع الرأس) ، يتم نسخ الرأس إلى عنصر بيانات البكسل
وهو غير قانوني لـ JP2. استخدم gdcmconv لإعادة تشفير ملف JP2 / JFIF بشكل صحيح إلى J2K / JPG.
gdcmimg $ input.jp2 output_jp2.dcm
$ gdcmconv --j2k - فرض الإخراج_jp2.dcm output_j2k.dcm
بالنسبة لملف RLE ، لا يتم إجراء فحص لعبور حدود الصف. يوصى باستخدامه
gdcmconv –rle لإعادة الترميز إلى ملف RLE مناسب في حالة الشك.
بالطبع إذا لم يكن الضغط مناسبًا للإعداد الخاص بك ، فيمكنك دائمًا إلغاء تغليف ملف
ملف DICOM (عادةً JPEG) إلى صيغة غير مغلفة ، باستخدام gdcmconv:
$ gdcmconv - رسم input_jpeg.dcm output_raw.dcm
استخدم gdcmimg عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
