هذا هو الأمر gt الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gt - نظام تحليل جينوم أدوات الجينوم.
موجز
gt [خيار ...] [أداة | نص] [حجة ...]
الوصف
-i [نعم | لا]
أدخل الوضع التفاعلي بعد التنفيذ أداة or سيناريو
-q [نعم | لا]
قمع تحذيرات
-اختبار [نعم | لا]
إجراء اختبارات الوحدة والخروج
-بذرة [قيمنا]
قم بتعيين البذور لمولد رقم عشوائي يدويًا. 0 يولد بذرة من الوقت الحالي
ومعرف العملية
-مساعدة
عرض المساعدة والخروج
-الإصدار
عرض معلومات الإصدار والخروج
الأدوات:
· bed_to_gff3
· أقراص مدمجة
· chain2dim
· com.chseqids
· نظيف
· يتألف
· التكثيف
· انسجام
· تحويل
· CSA
· نقطة
· مزدوج
· com.encseq
· com.encseq2spm
· وحدة التقييم
· مستخلص
· مقتطف
· fastq_sample
· ميزة الفهرس
· بصمة
· الوسيط الجينومي
· gff3
· gff3_to_gtf
· gff3validator
· gtf_to_gff3
· قفز
· id_to_md5
· inlineseq_add
· inlineseq_split
· تتداخل
· loccheck
· com.ltrclustering
· ltrdigest
· لتر الحصاد
· أداة الكبريت
· ماتستات
· md5_to_id
· دمج
· الاندماج
· ملغ
· mkfeatureindex
· com.mkfmindex
· com.mmapandread
· com.orffinder
· معبأة
· بريبوت
· اقرأ الانضمام
· إعادة البحث
· عامل تصفية البرنامج النصي
· البذور
· حدد
· يليها
· com.seqfilter
· seqids
· seqmutate
· seqorder
· com.seqstat
· com.seqtransform
· seqtranslate
· sequniq
· التقطيع
· شولينجديست
· سيمريدس
· رسم تخطيطي
· Sketch_page
· com.snpper
· بقعة
· splicesiteinfo
· سبليتفاستا
· القانون الأساسي
· لاحقة
· com.tagerator
· تالمير
· تيرفيش
· فريد
· com.uniquesub
· com.wtree
اضبط متغير البيئة GT_MEM_BOOKKEEPING = تشغيل لتمكين إمساك دفاتر الذاكرة (على سبيل المثال ،
مثل هذا: env GT_MEM_BOOKKEEPING = على GT).
اضبط متغير البيئة GT_ENV_OPTIONS = -spacepeak لإظهار Spacepeak بعد البرنامج
يركض. اضبط متغير البيئة GT_ENV_OPTIONS = -وقت العرض لإظهار أوقات المعالجة لـ
بعض أجزاء البرنامج إذا تم تنفيذها.
اضبط متغير البيئة GT_SEED على قيمة عددية لتزويد بذرة للعشوائية
مولد الرقم. يمكن تجاوزه بخيار البذور.
مجموعات ممكنة. تشغيل برنامج gt الثنائي مع GT_ENV_OPTIONS = -help يظهر الكل
ممكن "خيارات البيئة".
التبليغ بق
إبلاغ عن الأخطاء إلى[البريد الإلكتروني محمي]>.
استخدم gt عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net