miconv - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

miconv - يحول بيانات الصور الطبية بين الصيغ.

موجز

ميكونف [الخيارات] []

الوصف

miconv: يحول بيانات الصور الطبية بين التنسيقات.

يتم تحديد تنسيقات الملفات تلقائيًا من خلال امتداد الملف الخاص بها. ويتوقع عند
اسمان/دليلان على الأقل (لملف الإدخال والإخراج) في نهاية الملف
سطر الأوامر. الاستثناء هو الخيار '-l' الذي يتطلب خيارًا واحدًا فقط
اسم الملف/الدليل لسرد محتواه.

العلاجات العامة الخيارات:
-l: يسرد مجموعة مفصولة بمسافات من معلمات البروتوكول والمخارج. استخدم "-l help" للحصول على
قائمة المعلمات المحتملة و'-l all' لسرد كافة المعلمات. المعلمة
يجب حذف "ملف الإخراج" عند استخدام هذا الخيار.

-p: قم بتحميل هذا البروتوكول للإعدادات الافتراضية

بروتوكول الخيارات:
-تاريخ: تاريخ المسح [yyyymmdd] (افتراضي = 20140807yyyymmdd)

-fp: فوف في اتجاه الطور [مم] (افتراضي = 220.0 مم)

-الاب: فوف في اتجاه القراءة [مم] (افتراضي = 220.0 مم)

-fs: مجال الرؤية في اتجاه الشريحة [مم] (الافتراضي = 5.0 مم)

-رقم: عدد القياسات المتتالية (الافتراضي = 1)

-nx: عدد النقاط في اتجاه القراءة (افتراضي = 128)

-لا: عدد النقاط في اتجاه الطور (افتراضي = 128)

-nz: عدد النقاط في اتجاه الشريحة (افتراضي = 1)

-ولادة: تاريخ ميلاد المرضى [yyyymmdd] (افتراضي = 00000000yyyymmdd)

-معرّف: معرّف فريد للمريض (افتراضي = غير معروف)

-اسم: اسم المريض الكامل (افتراضي = غير معروف)

- الجنس: Patients sex (options = MFO، افتراضي = O)

-الوزن: وزن المريض [كجم] (افتراضي = 50.0 كجم)

-العالم: اسم العالم (افتراضي = غير معروف)

-SD: المسافة بين الشرائح (من المركز إلى المركز) [مم] (الافتراضي = 10.0 مم)

-سرد: وصف السلسلة (افتراضي = غير معروف)

-سيرنو: رقم المسلسل (افتراضي = 1)

-ST: سمك الشريحة [مم] (الافتراضي = 5.0 مم)

-عشيق: وصف الدراسة (افتراضي = غير معروف)

-tcname: اسم ملف الإرسال (افتراضي = غير معروف)

-ت: الوقت اللازم لصدى التسلسل [مللي ثانية] (الافتراضي = 80.0 مللي ثانية)

-زمن: وقت الفحص [hhmmss] (افتراضي = 091009hhmmss)

-تر: الوقت بين الإثارات المتتالية [مللي ثانية] (الافتراضي = 1000.0 مللي ثانية)

قم بتقديم اقرأ الخيارات:
-cplx: تعامل مع البيانات على أنها معقدة واستخرج المكون المحدد (الخيارات = لا شيء abs pha حقيقي
imag ، افتراضي = لا شيء)

-دس: فهرس مجموعة البيانات للاستخراج إذا تمت قراءة مجموعات بيانات متعددة

-منقي: اقرأ فقط مجموعات البيانات التي تحتوي معلمة البروتوكول "مفتاح" على السلسلة
"القيمة" (معطاة بالتنسيق "المفتاح = القيمة")

-fmap: لتقليل استخدام الذاكرة ، احتفظ بتخطيط الملفات بعد قراءة البيانات (الأولية) ، ولكن مع الكتابة
في المصفوفة سيؤدي إلى تحطم

-jdx: في حالة وجود مصفوفات JDX متعددة ، حدد هذا

-الخطاب: قراءة البيانات باستخدام لهجة معينة من التنسيق. (الافتراضي ليس لهجة)

-الترددات اللاسلكية: قراءة التنسيق واستخدامه لتجاوز امتداد الملف (الخيارات = الكشف التلقائي 3db تحليل تصاعدي
coi dat dcm تعويم مزدوج gz hdr idx ima interile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit ، افتراضي = كشف تلقائي)

-يتخطى: تخطي هذا المقدار من البايتات قبل قراءة البيانات الأولية (الافتراضي = 0)

قم بتقديم اكتب الخيارات:
-ألحق: إلحاق بالملف الموجود ، فقط للبيانات الأولية

-فنامبار: قائمة مفصولة بمسافة لمعلمات البروتوكول لتضمينها عند إنشاء فريد
أسماء الملفات

-لا مقياس: لا تقم بإعادة قياس القيم عند تخزين الأعداد الصحيحة

-انشق، مزق: فرض تقسيم أزواج البروتوكول والبيانات إلى ملفات منفصلة.

من نوع: نوع تمثيل الصورة (الخيارات = تعويم تلقائي مزدوج s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit ، افتراضي = تلقائي)

-لهجة: اكتب البيانات باستخدام لهجة معينة من التنسيق. (الافتراضي ليس لهجة)

-Wf: تنسيق الكتابة ، استخدمه لتجاوز امتداد الملف (الخيارات = الكشف التلقائي 3db تحليل تصاعدي
coi dat dcm تعويم مزدوج gz hdr idx ima interile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit ، افتراضي = كشف تلقائي)

-wp: قم بتخزين البروتوكول بشكل منفصل في هذا الملف.

المرشحات:
- محاذاة : محاذاة البيانات مع هندسة (مواقع فوكسل) الخاصة بـ
ملف خارجي

-قناع تلقائي : قم بإنشاء قناع باستخدام عتبة قائمة على الرسم البياني التلقائي

-تَجَمَّع : إنشاء مجموعات من voxels المجاورة / المجاورة غير الصفرية ، مرتبة حسب الحجم

- تتطور <نواة الالتواء (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp) ، قطر النواة [مم]>: الالتواء في الأبعاد المكانية

-رفض <عدد مكونات التردد المنخفض المراد إزالتها، متوسط ​​النتيجة صفر
timecourse>: إزالة الانجراف البطيء بمرور الوقت

-تعديل <سلسلة الموضع/النطاق في التنسيق (الإطار الزمني، الشرائح، المراحل، القراءة)، قيمة جديدة
من voxel>: تحرير قيم voxel المفردة

-قناع : قم بإنشاء قناع بما في ذلك جميع وحدات البكسل ذات القيمة
في نطاق معين

- الخواص : اجعل صورة voxels متساوية من خلال الاستيفاء (الصورة
الهندسة لن تتغير)

-تمرير منخفض : تصفية Lowpass

-الأعلى : قص جميع القيم فوق الحد الأقصى للقيمة

-Maxip : قم بإجراء إسقاط أقصى شدة
على اتجاه معين

-دمج : دمج مجموعات البيانات في مجموعة بيانات واحدة عن طريق توسيع البعد الزمني

-دقائق : قص جميع القيم التي تقل عن القيمة الدنيا

-مينيب : نفذ إسقاط الحد الأدنى من الشدة
على اتجاه معين

-لانا : يستبدل كل NaN بالقيمة المعطاة

-فليب : قلب البيانات في اتجاه المرحلة

-النطاق : حدد النطاق في
اتجاه المرحلة

-مشروع : أداء الإسقاط المتوسط ​​على ما هو محدد
اتجاه

-قناع كمي : قم بإنشاء قناع بما في ذلك جميع وحدات البكسل فوق الجزء المعطى
عتبة

-عينة : تغيير الحجم المؤقت لبيانات الصورة

-تغيير الحجم : تغيير الحجم المكاني لبيانات الصورة

-رسليس : يعيد تقسيم الصورة إلى معين
توجيه

-رفليب : قلب البيانات في اتجاه القراءة

-تعفن : دوران في الطائرة

-ترتيب : حدد النطاق في
اقرأ الاتجاه

-مقياس : إعادة قياس قيم الصورة

-قلب : قلب البيانات في اتجاه الشريحة

-تحول <إزاحة اتجاه القراءة [بكسل]، إزاحة اتجاه الطور [بكسل]، إزاحة اتجاه الشريحة [بكسل]
[بكسل]>: تحويل البيانات مكانيًا

-الوقت : صحيح لـ
نقاط زمنية مختلفة لاكتساب الشرائح

-لصق او جمع : لصق
الصورة في الاتجاه المحدد

-الترتيب : حدد النطاق في
اتجاه الشريحة

-سوابديم <[rps] [-] ، [rps] [-] ، [rps] [-]>: تبديل / عكس الأبعاد عن طريق تحديد اتجاه
ثلاث مرات مع إلحاق علامة انعكاس اختيارية

البلاط : دمج الشرائح في صورة مربعة ثنائية الأبعاد

-الترتيب : حدد النطاق في
اتجاه الوقت

-حفلة : تحويل البيانات في الوقت المناسب

-typemax : قص جميع القيم فوق الحد الأقصى لنوع بيانات معين

-طيف : قص جميع القيم الموجودة أسفل الحد الأدنى لنوع بيانات معين

-قناع : قم بإنشاء مجموعة بيانات 1D بما في ذلك جميع القيم داخل القناع من الملف

أخرى الخيارات:
-v أو لتصحيح / تتبع جميع المكونات أو ملف واحد
المكون ، على التوالي. القيم المحتملة لمستوى السجل هي: 0 (noLog) ، 1 (errorLog) ،
2 (سجل التحذير) ، 3 (سجل المعلومات).

-h, --مساعدة, -مساعدة, --الإصدار : اطبع نص التعليمات أو معلومات الإصدار

مدعومة ملف ملحقات (تنسيقات):
3db (بيانات Iris3D الثنائية)

تحليل
(NIFTI / ANALYZE ، اللهجات: FSL)

تصاعدي (ASCII ، اللهجات: tcourse)

coi (مجموعات بيانات JCAMP-DX)

dat (مصفوفة بيانات Matlab ascii 2D)

dcm (DICOM ، اللهجات: سيمنز)

مزدوج (بيانات خام مزدوجة)

تعويم (تعويم البيانات الخام)

gz (حاوية GNU-Zip للتنسيقات الأخرى)

hdr (ملف داخلي ، اللهجات: نيوروستات)

HDR (NIFTI / ANALYZE ، اللهجات: FSL)

idx (مؤشرات ثلاثية الأبعاد لغير الأصفار في ASCII)

ima (DICOM ، اللهجات: سيمنز)

تتداخل
(ملف ، لهجات: نيوروستات)

jdx (تنسيق صورة JCAMP-DX)

ماج (DICOM ، اللهجات: سيمنز)

MHD (صورة ميتا)

nii (NIFTI / ANALYZE ، اللهجات: fsl)

ph (DICOM ، اللهجات: سيمنز)

png (رسومات الشبكة المحمولة)

pos (مواضع xy لغير الأصفار في ASCII)

pro (بروتوكولات قياس ODIN)

ريج (أنسوفت HFSS ASCII)

s16bit (بيانات أولية موقعة 16 بت)

s32bit (بيانات أولية موقعة 32 بت)

s8bit (بيانات أولية موقعة 8 بت)

smp (مجموعات بيانات JCAMP-DX)

u16bit (بيانات خام 16 بت غير موقعة)

u32bit (بيانات خام 32 بت غير موقعة)

u8bit (بيانات خام 8 بت غير موقعة)

استخدم miconv عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net