هذا هو تطبيق Linux المسمى GapFiller والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم GapFiller-1.1.1.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى GapFiller مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
جابفيلر
Ad
الوصف
GapFiller عبارة عن مجمّع محلي للبذور والتمديد لملء الفراغ داخل القراءات المزدوجة.
يمكن استخدامه لكل من DNA و RNA وقد تم اختباره على بيانات Illumina.
يمكن استخدام GapFiller عندما يتم تجميع تسلسل بدءًا من القراءات الموضوعة على نهاياته ، بشرط تقدير فضفاض لطول التسلسل.
شرح المميزات:
- تنسيق الإدخال المدعوم: FASTQ (.gz ، .bz2) ، FASTA (.gz ، .bz2) ، SAM ، BAM
- معلمات تجميع عالية للتخصيص
- إمكانية تحديد مجموعات بيانات مختلفة للبذر والتجميع
- إمكانية تخزين معلومات التخطيط (قراءة الموقع والاتجاه داخل contigs المجمعة)
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
C + +
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/gapfiller/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
