هذا هو تطبيق Linux المسمى QUAST والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ quast-5.0.2.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى QUAST مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
كواست
الوصف
تجري QUAST تقييمًا سريعًا ومريحًا للجودة ومقارنة مجموعات الجينوم.
يحسب QUAST عددًا من المقاييس المعروفة ، بما في ذلك دقة contig وعدد الجينات المكتشفة و N50 وغيرها ، بالإضافة إلى إدخال مقاييس جديدة ، مثل NA50 (انظر التفاصيل في الورقة وفي الدليل). ينتج عن التحليل الشامل جداول الملخص (في نص عادي وتنسيقات مفصولة بعلامات جدولة و LaTeX) ومؤامرات ملونة. تقوم الأداة أيضًا بإنتاج تقارير تستند إلى الويب تعمل على تكثيف جميع المعلومات في ملف واحد يسهل التنقل فيه.
يحتوي QUAST على واجهة سطر أوامر بديهية ودليل مفصل لمساعدة المستخدمين على تشغيله وفهم مخرجاته. علاوة على ذلك ، بدأ المختبر إصدارًا تجريبيًا من الويب QUAST في http://quast.bioinf.spbau.ru/ مما يجعل تقييم الجودة أكثر بساطة.
تم نشر أوراق QUAST و MetaQUAST (امتداد للتجمعات الميتاجينومية) في Bioinformatics.
شرح المميزات:
- التقارير المستندة إلى الويب والجداول بتنسيقات النص العادي والمفصولة بعلامات جدولة و LaTeX
- المؤامرات والرسوم البيانية الملونة
- تقييم الجودة مع وبدون الجينوم المرجعي
- تقييم جودة التجميعات الميتاجينومية
- متصفح contig التفاعلي
الجمهور
العلوم / البحث والمطورين والمستخدمين / سطح المكتب
واجهة المستخدم
على شبكة الإنترنت ، سطر الأوامر
لغة البرمجة
بايثون وجافا سكريبت
التصنيفات
يمكن أيضًا جلب هذا التطبيق من https://sourceforge.net/projects/quast/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
