এটি গ্যাপফিলার নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি GapFiller-1.1.1.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
বিনামূল্যে অনওয়ার্কসের সাথে গ্যাপফিলার নামের এই অ্যাপটি অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
গ্যাপফিলার
Ad
বর্ণনাঃ
GapFiller হল একটি বীজ-এবং-প্রসারিত স্থানীয় অ্যাসেম্বলার যা জোড়া পড়ার মধ্যে ফাঁক পূরণ করতে।
এটি ডিএনএ এবং আরএনএ উভয়ের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে এবং এটি ইলুমিনা ডেটাতে পরীক্ষা করা হয়েছে।
GapFiller ব্যবহার করা যেতে পারে যখনই একটি সিকোয়েন্স একত্রিত করা হবে তার প্রান্তে থাকা রিড থেকে শুরু করে, ক্রম দৈর্ঘ্যের একটি আলগা অনুমান প্রদান করা হয়।
বৈশিষ্ট্য
- সমর্থিত ইনপুট বিন্যাস: FASTQ (.gz, .bz2), FASTA (.gz, .bz2), SAM, BAM
- অত্যন্ত কাস্টমাইজযোগ্য সমাবেশ পরামিতি
- বীজ বপন এবং সমাবেশের জন্য বিভিন্ন ডেটাসেট নির্দিষ্ট করার সম্ভাবনা
- লেআউট তথ্য সংরক্ষণ করার সম্ভাবনা (একত্রিত কন্টিগগুলির মধ্যে অবস্থান এবং অভিযোজন পড়ুন)
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কমান্ড লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি ++
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/gapfiller/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
