Dies ist der Befehl asn2fsa, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Anbieter über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
asn2fsa - biologische Sequenzdaten von ASN.1 in FASTA . konvertieren
ZUSAMMENFASSUNG
asn2fsa [-] [-A acc] [-D] [-E] [-H] [-L Dateinamen] [-T] [-a tippe] [-b] [-c] [-d Weg]
[-e N] [-f Weg] [-g] [-h Dateinamen] [-i Dateinamen] [-k] [-l] [-m] [-o Dateinamen] [-p Weg]
[-q Dateinamen] [-r] [-s] [-u] [-v Dateinamen] [-x str] [-z]
BESCHREIBUNG
asn2fsa konvertiert biologische Sequenzdaten von ASN.1 in FASTA.
OPTIONAL
Nachfolgend finden Sie eine Zusammenfassung der Optionen.
- Nutzungsnachricht drucken
-A acc Beitritt zu holen
-D Verwenden Sie Dash für Gap
-E Erweiterte Seq-IDs
-H HTML-Spannen
-L Dateinamen
Logdatei
-T Threads verwenden
-a tippe
Typ ASN.1 eingeben:
a Automatisch (Standard)
z Beliebig
e Seq-Eintrag
b Bioseq
s Bioseq-Set
m Seq-senden
t Stapelverarbeitung (geeignet für behördliche Freigaben; erkennt bestimmten Typ automatisch)
-b Bioseq-set ist binär
-c Bioseq-set ist komprimiert
-d Weg
Pfad zur ReadDB-Datenbank
-e N Zeilenlänge (standardmäßig 70; kann zwischen 10 und 120 liegen)
-f Weg
Pfad zu indizierten FASTA-Daten
-g Erweitern Sie Delta-Lücken in Ns
-h Dateinamen
Name der Ausgabedatei für den Cache der fernen Komponente
-i Dateinamen
Einzeleingabedatei (standardmäßig Standardeingabe)
-k Lokales Abrufen
-l Komponenten vorab sperren
-m Master-Style für nahezu segmentierte Sequenzen
-o Dateinamen
Nukleotid-Ausgabedateiname
-p Weg
Pfad zu ASN.1-Dateien
-q Dateinamen
Name der Ausgabedatei des Qualitätsfaktors
-r Fernabruf von NCBI
-s Weites genomisches Contig für Qualitätsscores
-u Recurse
-v Dateinamen
Dateiname der Proteinausgabe
-x str Dateiauswahl-Teilzeichenfolge (.ent standardmäßig) [Zeichenfolge]
-z Druckqualitäts-Score-Lücke als -1
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