Dies ist der Befehl bp_tree2pagp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
bp_tree2pag – konvertiert Bäume im analysierbaren Bio::TreeIO-Format in das Pagel-Format
ZUSAMMENFASSUNG
bp_tree2pag -if nexus -i file.nexus > file.pag
# ODER über STDIN weiterleiten und stattdessen das Newick-Format verwenden
cat-Datei.newick | bp_tree2pag -if newick > file.nh
# ODER geben Sie einen Ausgang und einen Eingang an
bp_tree2pag -o file.pag -i file.newick
BESCHREIBUNG
Konvertieren Sie analysierbare TreeIO-Dateien in Baumdateien im Pagel-Format. Seien Sie vor dem Pagel-Format gewarnt
Unterstützt also eigentlich nur einen einzelnen Baum pro Datei. Auch Pagel-Parsing ist noch nicht verfügbar
in Bioperl.
Verwenden Sie bp_tree2pagp online über die Dienste von onworks.net
