cmtk-vol2csv - Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

vol2csv - Berechnen Sie regionale Volumes und schreiben Sie in eine CSV-Datei.

ZUSAMMENFASSUNG

vol2csv RegionenBilddichteBilder

BESCHREIBUNG

Dieses Werkzeug berechnet die Volumina von Regionen in einem Etikettenbild. Es akzeptiert optional Dichte
Karten (z. B. für verschiedene Gewebe) und berechnet und druckt den Inhalt pro Region für
jede einzelne. Außerdem kann das Tool eine optionale 'Pixelvolumen'-Zuordnung akzeptieren, um lokale Pixel zu berücksichtigen
Lautstärkeschwankungen, zB aufgrund von räumlicher Verzerrung.

OPTIONAL

Global Toolkit Optionen (diese sind von Locals geführtes by alle CMTK Werkzeuge)
--help
Schreiben Sie eine Liste der grundlegenden Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

--Hilf allen
Schreiben Sie eine vollständige Liste der grundlegenden und erweiterten Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

- Wiki
Schreiben Sie eine Liste der Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe im MediaWiki-Markup.

--Mann
Schreiben Sie die Manpage-Quelle im 'nroff'-Markup in die Standardausgabe.

--Version
Schreiben Sie die Toolkit-Version in die Standardausgabe.

--Echo
Schreiben Sie die aktuelle Befehlszeile in die Standardausgabe.

--verbose-level
Ausführlichkeitsstufe festlegen.

- ausführlich, -v
Erhöhen Sie die Ausführlichkeitsstufe um 1 (veraltet; aus Gründen der Abwärtskompatibilität unterstützt).

--fäden
Legen Sie die maximale Anzahl paralleler Threads fest (für POSIX-Threads und OpenMP).

zufuhr Optionen
--normalize-densities
Optionaler Normalisierungsfaktor für Dichtebilder. Normalerweise sind die Werte im
Dichtebilder sollten im Bereich 0..1 liegen, aber oft werden solche Bilder auf . skaliert
verschiedene Bereiche, um die Speicherung als Ganzzahlen zu ermöglichen. Wenn zum Beispiel Dichten
als Werte 0..255 gespeichert, setzen Sie diesen Parameter auf 255. [Standard: 1]

--labels-Datei
Falls angegeben, enthält diese Textdatei Namen für alle Labels im Regionsbild. Diese
Namen werden dann verwendet, um die Zeilen der CSV-Ausgabe zu beschriften. [Standard: KEINER]

Korrektur Optionen
--pixel-scale-factor
Falls vorhanden, wird dieser globale Skalierungsfaktor auf alle Pixelvolumina angewendet, um dies zu kompensieren
für Abweichungen zwischen Welt- und Abbildungsmaßstab. [Standard: 1]

--pixel-scale-image
Falls vorgesehen, enthält dieses Volumen Skalierungsfaktoren für das Volumen jedes Pixels. Das ist
typischerweise die Jacobi-Determinantenkarte einer räumlichen Entzerrungsdeformation. [Standard:
KEINER]

Output Optionen
--dichte-labels
Diese Option kann verwendet werden, um Beschriftungen für die Dichtekarten bereitzustellen, die als
Spaltenbeschriftungen in der Ausgabe. Labels müssen durch Kommas getrennt werden und dürfen kein enthalten
alle nicht maskierten Leerzeichen. [Standard: KEINER]

--Ausgabe , -o
Falls vorhanden, wird die Programmausgabe in diese Datei geschrieben. Wenn nicht angegeben, ist die Ausgabe
in den STDOUT-Stream geschrieben. [Standard: KEINER]

AUTOREN

Torsten Rohlfing, mit Beiträgen von Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakow und Yaroslav Halchenko

Verwenden Sie cmtk-vol2csv online mit den onworks.net-Diensten