Dies ist der Befehl ecofind, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
ecofind – Suche nach taxonomischer und Rang- und Taxonomie-ID für einen bestimmten regulären Ausdruck
Muster
BESCHREIBUNG
ecoPCR ist eine von LECA und Helix-Project entwickelte elektronische PCR-Software. Es hilft
Schätzen Sie die Qualität der Barcode-Primer ein.
Dieses Programm gehört zum exoPCR-Paket.
ZUSAMMENFASSUNG
ecofind [Optionen]
OPTIONAL
-a : [A]ll aktiviert die Suche nach allen alternativen Namen und nicht nur nach wissenschaftlichen Namen.
-d : [Datenbank, die die Taxonomie enthält.
Um dem erwarteten Format zu entsprechen, muss die Datenbank zunächst von formatiert werden
Das Programm ecoPCRFormat.py befindet sich im Tools-Verzeichnis. Schreiben Sie das Datenbankradikal
ohne jegliche Verlängerung.
-h : [H]elp - drucken Hilfe
-l : [L]ist der gesamte verfügbare taxonomische Rang -r zu erhalten
-P : [P]ath: Fügen Sie eine Spalte hinzu, die den vollständigen Pfad für jedes angezeigte Taxon enthält
-p : [P]arents: Wenn Sie diese Option angeben, werden alle Informationen zum übergeordneten Baum angezeigt
Taxid gegeben.
-r : [R]auf gegebenen taxonomischen Rang beschränken
-s : [S]ons: Wenn Sie diese Option angeben, werden alle Informationen des Unterbaums für den angegebenen angezeigt
Steuer ID.
-P : Taxonomischen [P]ath als zusätzliche Spalte in der Ausgabe anzeigen
Argumente:
Namensmuster, das reguläre Ausdrücke enthält
Nutzen Sie ecofind online über die Dienste von onworks.net
