Dies ist der Befehl ecogrep, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
ecogrep – Filterung des ecoPCR-Ergebnisses basierend auf taxonomischem ID-Filter und regulärem Ausdruck
Anleitungen
ZUSAMMENFASSUNG
Ökogrep [Optionen] Dateinamen
BESCHREIBUNG
ecoPCR ist eine von LECA und Helix-Project entwickelte elektronische PCR-Software. Es hilft
Schätzen Sie die Qualität der Barcode-Primer ein.
Dieses Programm gehört zum exoPCR-Paket.
OPTIONAL
-1 : [ERST]: Vergleichen Sie das angegebene Muster mit dem Direktstrang-Oligonukleotid
-2 : [ZWEITER]: Vergleichen Sie das angegebene Muster mit dem Rückstrang-Oligonukleotid
-d : [Datenbank mit taxonomischen Informationen
-e : [Fehler: Maximal zulässiger Fehler beim Mustervergleich (Option-1, -2 und -p) (0 von
Standard)
-p : [P]attern: Oligonukleotidmuster
-h : [H]Hilfe: Drucken Hilfe
-i : [I]ignoriere den Teilbaum unter der angegebenen taxonomischen ID
-r : [R]Suche auf Teilbaum unter gegebener taxomischer ID beschränken
-v : Fügen Sie den Sinn der Übereinstimmung ein, um nicht übereinstimmende Zeilen auszuwählen.
Argument:
Name der ecoPCR-Ausgabedatei
Nutzen Sie ecogrep online über die Dienste von onworks.net
