Dies ist der Befehl fastaq-to_tiling_bam, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fastaq_to_tiling_bam – Erstellen Sie eine BAM-Datei mit Lesevorgängen, die gleichmäßig über die Eingabe verteilt sind
Referenz
BESCHREIBUNG
Verwendung: fastaq_to_tiling_bam [Optionen]
Nimmt eine Sequenzdatei auf. Erstellt eine BAM-Datei mit perfekten (ungepaarten) Lesevorgängen, die kachelt
ganzes Genom
positionell Argumente:
infile Name der Eingabe-Fasta/Q-Datei
read_length
Länge der Lesevorgänge
read_step
Abstand zwischen dem Beginn jedes Lesevorgangs
read_prefix
Präfix der gelesenen Namen
Outfile
Name der BAM-Ausgabedatei
optional Argumente:
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
--qual_char QUAL_CHAR
Für den Qualitätsfaktor zu verwendendes Zeichen [I]
--read_group READ_GROUP
Fügen Sie die angegebene Lesegruppen-ID zu allen Lesevorgängen hinzu [42]
Wichtig: geht davon aus, dass sich samtools auf Ihrem Weg befindet
Verwenden Sie fastaq-to_tiling_bam online über die Dienste von onworks.net
