Dies ist der Befehl gt-matchtool, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gt-matchtool – Match-Formate analysieren und/oder Matching-Tools aufrufen.
ZUSAMMENFASSUNG
gt Matchtool [Möglichkeit ...]
BESCHREIBUNG
-Art [...]
Wählen Sie das passende Dateiformat: OPENMATCH: XNUMXh geöffnet Spiel Format, z. B. vmatch BLASTOUT: tabellarisch
BLAST-Ausgabe (-m 8) BLASTALLP: BLASTALL mit Blastp aufrufen BLASTALLN: BLASTALL aufrufen
mit Blastn BLASTP: Blastp aufrufen BLASTN: Blastn aufrufen LAST: LAST aufrufen SW: verwenden
Smith-Waterman (Standard: OPENMATCH)
-matchfile [Dateinamen]
Eingabedateinamen festlegen (Standard: undefiniert)
-db [Dateinamen]
Datenbankdateinamen festlegen (Standard: undefiniert)
-swminlen [Wert]
Legen Sie die minimal erforderliche Ausrichtungslänge fest (für Smith-Waterman-Ausrichtung) (Standard: 10)
-swmaxedist [Wert]
Legen Sie den maximal zulässigen Bearbeitungsabstand fest (für Smith-Waterman-Ausrichtung) (Standard: 0)
-Anfrage [Dateinamen]
Namen der Abfragedatei festlegen (Standard: undefiniert)
-Hilfe
Hilfe anzeigen und beenden
-Ausführung
Versionsinformationen anzeigen und beenden
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