Dies ist der Befehl kmc_tools-counters_subtract, der im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows Online-Emulator oder MAC OS Online-Emulator ausgeführt werden kann.
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
kmc_tools-counters_subtract - berechnet die Subtraktion der Zähler zweier KMC-Datenbanken
ZUSAMMENFASSUNG
kmc_tools counters_subtract <output
[output_params]>
BESCHREIBUNG
Die Ausgabedatenbank enthält nur K-Mere, die im ersten Eingabesatz vorhanden sind und
haben höhere Zähler als die entsprechenden K-Mere im zweiten Satz. Für jedes K-Mer ist
Der Zähler ist gleich der Differenz zwischen dem Zähler im ersten Satz und dem Zähler im
der zweite Satz.
OPTIONAL
Für jede Eingabe gibt es zusätzliche Parameter:
-ci
k-mers ausschließen, die weniger als auftreten mal
-cx
Schließen Sie k-mere aus, die häufiger vorkommen mal
Für die Ausgabe gibt es zusätzliche Parameter:
-ci
k-mers ausschließen, die weniger als auftreten mal
-cx
Schließen Sie k-mere aus, die häufiger vorkommen mal
-cs
Maximalwert eines Zählers
BEISPIEL
kmc - k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
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