Dies ist der Befehl kmc_tools, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
kmc_tools – zusätzliche Operationen für k-mer-Datenbanken
ZUSAMMENFASSUNG
kmc_tools [globale Parameter] [Betriebsparameter]
BESCHREIBUNG
Dieser Befehl und seine verschiedenen Unterkommentare implementieren eine Reihe von Operationen auf KMC
Datenbanken.
k-mers Sets Geschäftstätigkeit für 2 KMC Datenbanken
schneiden
Schnittmenge von 2 k-mers-Sätzen
kmers_subtract
Subtraktion von 2 k-mers-Sätzen
counters_subtract
kontert die Subtraktion von 2 k-mer-Sätzen
Gewerkschaft
Vereinigung von 2 k-meren Mengen
Geschäftstätigkeit für Single kmc Datenbank
sortieren
Sortiert k-mers aus der von KMC2.x generierten Datenbank
Veteran
Schließen Sie zu seltene und zu häufige K-Mer aus
kompakt
Zähler entfernen (nur K-Mer speichern)
Histogramm
Histogramm der k-mers-Vorkommen
abladen
K-Mer und Zähler in eine Textdatei kopieren
mehr Komplex Operationen:
Komplex
komplexe Operationen mit einer Reihe von Eingabedatenbanken
Andere Operationen:
Filter
Filtern Sie Lesevorgänge mit einer zu geringen Anzahl an k-meren heraus
OPTIONAL
globale Parameter:
-T
Gesamtzahl der Threads (Standard: Anzahl der CPU-Kerne)
-v
Ausführlichen Modus aktivieren (zeigt einige Informationen an) (Standard: false)
-PS
Prozentualen Fortschritt ausblenden (Standard: false)
BEISPIEL
kmc_tools Union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
Verwenden Sie kmc_tools online über die Dienste von onworks.net
