Dies ist der Befehl „mapMers- Depth“, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
MapMers-Tiefe – Berichtsinformationen zum Zuordnen von Kilometern zu Sequenzen
ZUSAMMENFASSUNG
MapMers-Tiefe {-Anzahl|-Tiefe|-Statistiken} -mers MERYL -m MERSIZE -seq IN.FASTA
OPTIONAL
Modi of Betrieb
Für Sequenz-Ordinalzahlen „s“ und Position in dieser Sequenz „p“:
-Anzahl meldet die Anzahl (c) des einzelnen Kilometers, der an Position (p) beginnt.
Format: 'spc'
-Tiefe Gibt die Anzahl (n) der Kilometer an, die sich über die Position (p) erstrecken.
Format: 'spn'
-Statistiken Gibt die minimale (m), maximale (M) und durchschnittliche (a) Anzahl aller Mers an, die sich überspannen
Position (p). meldet auch die Gesamtzahl (t) und die Anzahl der Kilometer (n)
Format: 'spm M atn'
Allgemeines
-m MERSIZE
-mers MERYL
Meryl(1) Datenbank
-seq IN.FASTA
Fasta-Eingabesequenz
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