Dies ist der Befehl vcf-phased-join, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
vcf-phased-join – nimmt mehrere überlappende vorphasige Chunks und verkettet sie
ein VCF
ZUSAMMENFASSUNG
vcf-phased-join [OPTIONAL] A.vcf B.vcf C.vcf
BESCHREIBUNG
Info: Das Skript nimmt mehrere überlappende vorphasige Blöcke und verkettet sie
ein VCF
Verwendung heterozygoter Anrufe aus den Überlappungen, um die richtige Phase zu bestimmen.
OPTIONAL
-j, --min-join-quality
Qualitätsschwelle für die Verklebung der vorgefertigten Blöcke [10]
-l, --aufführen
Liste der VCFs, denen man beitreten kann.
-o, --Ausgabe
Name der Ausgabedatei. Wenn „-“ angegeben wird, werden STDOUT und STDERR verwendet
-q, --min-PQ
Unterbrechen Sie vorphasengesteuerte Segmente, wenn der PQ-Wert in den Eingangs-VCFs [0.6] niedriger ist.
-h,-?, --help
Diese Hilfenachricht
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