Dies ist die Linux-App mit dem Namen PRIMUS, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als URLtoLastestPRIMUSversion.txt heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PRIMUS herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
PRIMUS läuft online unter Linux
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BESCHREIBUNG
NEU: Laden Sie die neue Version mit Pedigree Reconstruction unter primus.gs.washington.edu herunterDiese Version ist veraltet und unvollständig. Die Vollversion von PRIMUS finden Sie auf der neuen Website.
Wir stellen eine aus der Graphentheorie adaptierte Methode vor, die immer die maximale Menge nicht verwandter Personen in jedem Datensatz identifiziert und die Verwendung von Gewichtungsparametern bei der Auswahl nicht verwandter Stichproben ermöglicht. PRIMUS liest benutzergenerierte IBD-Schätzungen ein und gibt die maximal mögliche Menge nicht verwandter Personen unter Berücksichtigung eines bestimmten Verwandtschaftsschwellenwerts aus. Zusätzliche Informationen zur bevorzugten Auswahl von Personen können ebenfalls genutzt werden. Wenn es beispielsweise in einem Netzwerk maximal zwei gleich große Gruppen unabhängiger Personen gibt, kann PRIMUS vorzugsweise die Gruppe mit den stärker betroffenen Personen auswählen.
Abonnieren Sie die E-Mail-Liste PRIMUS-Benutzer für Benachrichtigungen über Updates und neue Versionen.
Relevante Software:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Eigenschaften
- Identifiziert die maximale Anzahl nicht verwandter Personen aus einem genetischen Datensatz
- Gruppiert Proben in Familiennetzwerke
- Erzeugt .dot-Dateien zur Visualisierung von Familiennetzwerken
Publikum
Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung, Bildung
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/primus-beta/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
