Dies ist die Linux-App namens Seurat, deren neueste Version als Version 5.3.0sourcecode.tar.gz heruntergeladen werden kann. Sie kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Seurat mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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Seurat
BESCHREIBUNG
Seurat ist ein umfassendes R-Toolkit für die Einzelzellgenomikanalyse, das vom Satija Lab am NYGC eingeführt wurde. Es unterstützt Qualitätskontrolle, Normalisierung, Clustering, Integration multimodaler Daten (z. B. scRNA-seq, räumlich, CITE-seq) und Visualisierung. Seurat v5 bietet skalierbare Workflows und Unterstützung für räumliche Transkriptomik, die in der akademischen und industriellen Forschung für Einzelzellstudien häufig eingesetzt wird.
Eigenschaften
- Qualitätskontroll- und Normalisierungspipelines für scRNA-seq
- Dimensionsreduktion, Clustering und Zelltyp-Annotation
- Integration über Proben und Modalitäten hinweg
- Räumliche Transkriptomikanalyse und Visualisierung
- Verarbeitet große Datensätze effizient (v5-Skalierbarkeit)
- Umfangreiche Vignetten, Tutorials und Integration mit Bioconductor
Programmiersprache
R
Kategorien
Diese Anwendung kann auch von https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/ heruntergeladen werden. Sie wurde in OnWorks gehostet, um sie auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme aus ausführen zu können.
