Este es el comando ecogrep que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
ecogrep: filtrado del resultado ecoPCR basado en el filtro de identificación taxonómica y la expresión regular
patrón
SINOPSIS
ecogrep [opciones] nombre de archivo
DESCRIPCIÓN
ecoPCR es un software de PCR electrónico desarrollado por LECA y Helix-Project. Ayuda a
Estimar la calidad de los imprimadores de códigos de barras.
Este programa pertenece al paquete exoPCR.
CAMPUS
-1 : [PRIMERO]: compare el patrón dado con el oligonucleótido de cadena directa
-2 : [SEGUNDO]: compare el patrón dado con el oligonucleótido de hebra inversa
-d : [D] una base que contiene información taxonómica
-e : [E] errores: error máximo permitido en la coincidencia de patrones (opción-1, -2 y -p) (0 por
defecto)
-p : [P] attern: patrón de oligonucleótidos
-h : [H] elp: imprimir ayuda
-i : [I] gnore el subárbol bajo el ID taxonómico dado
-r : [R] búsqueda estricta en el subárbol con una identificación taxómica determinada
-v : en [V] ert el sentido de coincidencia, para seleccionar líneas que no coinciden.
argumento:
nombre del archivo de salida ecoPCR
Utilice ecogrep en línea utilizando los servicios de onworks.net
