Este es el comando gt-sketch que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gt-sketch: crea una representación gráfica de los archivos de anotaciones GFF3.
SINOPSIS
gt bosquejo [opción ...] archivo_imagen [archivo_GFF3 ...]
DESCRIPCIÓN
-tubo [si | no]
usar el modo de tubería (es decir, mostrar todas las características de gff3 en stdout) (predeterminado: no)
-Archivos planos [si | no]
no agrupe las pistas por nombre de archivo de origen y elimine los nombres de archivo de la descripción de la pista
(predeterminado: no)
-seqid [cadena]
identificador de región de secuencia predeterminado: primero en el archivo
-Comienzo [valor]
posición de inicio predeterminada: inicio de la primera región
-final [valor]
posición final por defecto: final de la última región
-anchura [valor]
ancho de la imagen de destino (en píxeles) (predeterminado: 800)
-Estilo [cadena]
archivo de estilo a usar (predeterminado: indefinido)
-formato [...]
formato de gráficos de salida elija entre png | pdf | svg | ps (predeterminado: png)
-aporte [...]
formato de datos de entrada elija entre gff | bed | gtf (predeterminado: gff)
-addintrones [si | no]
agregar características de intrón entre características de exón existentes (antes del dibujo) (predeterminado: no)
-inseguro [si | no]
habilitar el modo inseguro para el archivo de estilo (predeterminado: no)
-v [si | no]
ser detallado (predeterminado: no)
-fuerza [si | no]
forzar la escritura en el archivo de salida (predeterminado: no)
-ayuda
mostrar ayuda y salir
-versión
mostrar información de la versión y salir
PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO
Informar errores a[email protected]>.
Use gt-sketch en línea usando los servicios de onworks.net
