Este es el comando kmc_tools-counters_subtract que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
kmc_tools-counters_subtract - calcula la resta de contadores de dos bases de datos KMC
SINOPSIS
kmc_herramientas contadores_restar <output
[output_params]>
DESCRIPCIÓN
La base de datos de salida contendrá solo los k-mers que están presentes en el primer conjunto de entrada y
tienen contadores más altos que los k-mers apropiados en el segundo conjunto. Para cada k-mer el
contador es igual a la diferencia entre el contador en el primer conjunto y el contador en
el segundo juego.
CAMPUS
Para cada entrada hay parámetros adicionales:
-ci
excluir k-mers que ocurren menos de veces
-cx
excluir k-mers que ocurren más de veces
Para la salida hay parámetros adicionales:
-ci
excluir k-mers que ocurren menos de veces
-cx
excluir k-mers que ocurren más de veces
-cs
valor máximo de un contador
EJEMPLO
kmc - archivo k28.fastq kmers1 tmp
kmc - archivo k28.fastq kmers2 tmp
kmc_tools contadores_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Use kmc_tools-counters_subtract en línea usando los servicios de onworks.net
