Este es el comando mapMers-depth que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
mapMers-depth - reporta información sobre mapeo de kmers a secuencias
SINOPSIS
mapMers-profundidad {-contar|-profundidad|-estadísticas} -mers Meryl -m TAMAÑO MERSIZE -sec EN.RÁPIDO
CAMPUS
Modos of Inteligente
Para la secuencia ordinal 's' y la posición en esa secuencia 'p':
-contar informa el recuento (c) del único kmer que comienza en la posición (p).
Formato: 'spc'
-profundidad informa el número (n) de kmers que abarcan la posición (p).
Formato: 'spn'
-estadísticas informa el recuento mínimo (m), máximo (M) y promedio (a) de todos los mers que abarcan
posición (p). también informa el recuento total (t) y el número de kmers (n)
Formato: 'spm M atn'
General
-m TAMAÑO MERSIZE
-mers Meryl
meryl(1) base de datos
-sec EN.RÁPIDO
secuencia de entrada rápida
Utilice mapMers-depth en línea utilizando los servicios de onworks.net
