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Descarga QUAST para Linux

Descarga gratuita de la aplicación QUAST Linux para ejecutar en línea en Ubuntu en línea, Fedora en línea o Debian en línea

Esta es la aplicación de Linux llamada QUAST cuya última versión se puede descargar como quast-5.0.2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.

Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada QUAST with OnWorks de forma gratuita.

Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:

- 1. Descargue esta aplicación en su PC.

- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.

- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.

- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.

- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.

- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.

SCREENSHOTS

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CUATRO


DESCRIPCIÓN

QUAST realiza una evaluación y comparación de calidad rápida y conveniente de conjuntos de genomas.

QUAST calcula una serie de métricas conocidas, incluida la precisión de contig, el número de genes descubiertos, N50 y otros, así como la introducción de nuevos, como NA50 (consulte los detalles en el documento y en el manual). Un análisis completo da como resultado tablas de resumen (en texto sin formato, formatos separados por tabuladores y LaTeX) y gráficos coloridos. La herramienta también produce informes basados ​​en la web que condensan toda la información en un archivo de fácil navegación.

QUAST tiene una interfaz de línea de comandos intuitiva y un manual detallado para ayudar a los usuarios a ejecutarlo y comprender su salida. Además, el laboratorio inició una versión Beta de web-QUAST en http://quast.bioinf.spbau.ru/ lo que simplifica aún más la evaluación de la calidad.

Los artículos QUAST y MetaQUAST (extensión para ensamblajes metagenómicos) se publicaron en Bioinformatics.



Caracteristicas

  • informes basados ​​en web, tablas en txt simple, formatos separados por tabuladores y LaTeX
  • gráficos e histogramas de colores
  • evaluación de la calidad con y sin genoma de referencia
  • evaluación de la calidad de los ensamblajes metagenómicos
  • navegador contig interactivo


Audiencia

Ciencia / Investigación, Desarrolladores, Usuarios finales / Escritorio


Interfaz de usuario

Línea de comandos basada en web


Lenguaje de programación

Pitón, JavaScript


Categorías

Bioinformática, Visualización, Test y Medida

Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/quast/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.


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