Esta es la aplicación para Linux llamada Seurat, cuya última versión se puede descargar como Version5.3.0sourcecode.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Seurat con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Seurat
DESCRIPCIÓN
Seurat es un completo conjunto de herramientas de R para el análisis genómico de células individuales, presentado por el Laboratorio Satija del NYGC. Facilita el control de calidad, la normalización, la agrupación, la integración de datos multimodales (p. ej., scRNA-seq, espaciales, CITE-seq) y la visualización. Seurat v5 introduce flujos de trabajo escalables y compatibilidad con la transcriptómica espacial, de uso común en la investigación académica e industrial para estudios de células individuales.
Caracteristicas
- Tuberías de control de calidad y normalización para scRNA-seq
- Reducción dimensional, agrupamiento y anotación de tipos de células
- Integración entre muestras y modalidades
- Análisis y visualización transcriptómica espacial
- Maneja conjuntos de datos a gran escala de manera eficiente (escalabilidad v5)
- Amplias viñetas, tutoriales e integración con Bioconductor
Lenguaje de programación
R
Categorías
Esta aplicación también se puede descargar desde https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/. Está alojada en OnWorks para facilitar su ejecución en línea desde uno de nuestros sistemas operativos gratuitos.
