Il s'agit de la commande bp_tree2pagp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_tree2pag - convertit les arbres de format analysables Bio::TreeIO au format pagel
SYNOPSIS
bp_tree2pag -if nexus -i fichier.nexus > fichier.pag
# OU connectez-vous via STDIN et utilisez le format Newick à la place
fichier cat.newick | bp_tree2pag -si newick > fichier.nh
# OU spécifiez une sortie et une entrée
bp_tree2pag -o fichier.pag -i fichier.newick
DESCRIPTION
Convertissez les fichiers analysables TreeIO en fichiers arborescents au format Pagel. Attention : le format Pagel
Par conséquent, seule une arborescence par fichier est prise en charge. L'analyse Pagel n'est pas encore disponible.
dans bioperl.
Utilisez bp_tree2pagp en ligne à l'aide des services onworks.net