Il s'agit de la commande ecogrep qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
ecogrep - filtrage du résultat ecoPCR basé sur le filtre d'identification taxonomique et l'expression régulière
modèle
SYNOPSIS
écogrep [choix] nom de fichier
DESCRIPTION
ecoPCR est un logiciel PCR électronique développé par LECA et Helix-Project. Cela aide à
estimer la qualité des amorces de codes-barres.
Ce programme appartient au package exoPCR.
OPTIONS
-1 : [FIRST] : comparer le motif donné avec un oligonucléotide à brin direct
-2 : [DEUXIÈME] : comparer le motif donné avec l'oligonucléotide à brin inverse
-d : [D]base de données contenant des informations taxonomiques
-e : [E]rrors : erreur max autorisée dans la correspondance de modèle (option-1, -2 ainsi que -p) (0 par
défaut)
-p : [P]attern : motif oligonucléotidique
-h : [A]ide : imprimer aider
-i : [I] ignore le sous-arbre sous l'identifiant taxonomique donné
-r : [R]restreindre la recherche au sous-arbre sous l'identifiant taxomique donné
-v : in[V]ert le sens de la correspondance, pour sélectionner les lignes qui ne correspondent pas.
argument:
nom du fichier de sortie ecoPCR
Utilisez ecogrep en ligne en utilisant les services onworks.net