Il s'agit de la commande gt-matchtool qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gt-matchtool - Analyse les formats de correspondance et/ou invoque des outils de correspondance.
SYNOPSIS
gt allumette [option ...]
DESCRIPTION
De type [ ]
choisissez le format de fichier correspondant : OPENMATCH : ouvert rencontre format, par exemple vmatch BLASTOUT : tabulaire
BLAST sortie (-m 8) BLASTALLP : invoque BLASTALL avec blastp BLASTALLN : invoque BLASTALL
avec blastn BLASTP : invoquer blastp BLASTN : invoquer blastn LAST : invoquer LAST SW : utiliser
Smith-Waterman (par défaut : OPENMATCH)
-fichier de correspondance [nom de fichier]
définir le nom du fichier d'entrée (par défaut : non défini)
-Db [nom de fichier]
définir le nom du fichier de base de données (par défaut : non défini)
-swminlen [Plus-value]
définir la longueur d'alignement minimale requise (pour l'alignement Smith-Waterman) (par défaut : 10)
-swmaxedist [Plus-value]
définir la distance d'édition maximale autorisée (pour l'alignement Smith-Waterman) (par défaut : 0)
-mettre en doute [nom de fichier]
définir le nom du fichier de requête (par défaut : non défini)
-Aide
afficher l'aide et quitter
-version
afficher les informations de version et quitter
DE LA LIGNE BOGUES
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