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mapMers-depth - En ligne dans le Cloud

Exécutez mapMers-depth dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks sur Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

Il s'agit de la commande mapMers-depth qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

PRÉNOM


mapMers-depth - rapporte des informations sur le mappage des kmers aux séquences

SYNOPSIS


mapMers-profondeur {-compter|-profondeur|-Statistiques} -mers MERYL -m MERSIZE -seq EN.FASTA

OPTIONS


Modes of opération
Pour l'ordinal de séquence 's' et la position dans cette séquence 'p' :

-compter rapporte le décompte (c) du seul kmer qui commence à la position (p).

Format : « spc »

-profondeur rapporte le nombre (n) de kmeurs qui s'étendent sur la position (p).

Format : « spn »

-Statistiques rapporte le nombre minimum (m), maximum (M) et moyen (a) de tous les mers qui s'étendent
poste (p). rapporte également le nombre total (t) et le nombre de kmers (n)

Format : « spm Matn »

Spécifications générales
-m MERSIZE

-mers MERYL
Meryl(1) base de données

-seq EN.FASTA
séquence d'entrée fasta

Utilisez mapMers-depth en ligne en utilisant les services onworks.net


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