Il s'agit de la commande mapMers-depth qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mapMers-depth - rapporte des informations sur le mappage des kmers aux séquences
SYNOPSIS
mapMers-profondeur {-compter|-profondeur|-Statistiques} -mers MÉRYL -m MERSIZE -séq EN.FASTA
OPTIONS
Modes of opération
Pour l'ordinal de séquence 's' et la position dans cette séquence 'p' :
-compter rapporte le décompte (c) du seul kmer qui commence à la position (p).
Format : « spc »
-profondeur rapporte le nombre (n) de kmeurs qui s'étendent sur la position (p).
Format : « spn »
-Statistiques rapporte le nombre minimum (m), maximum (M) et moyen (a) de tous les mers qui s'étendent
poste (p). rapporte également le nombre total (t) et le nombre de kmers (n)
Format : « spm Matn »
Général
-m MERSIZE
-mers MÉRYL
Meryl(1) base de données
-séq EN.FASTA
séquence d'entrée fasta
Utilisez mapMers-depth en ligne en utilisant les services onworks.net
