Il s'agit de l'application Linux nommée ASpipe dont la dernière version peut être téléchargée sous ASpipe2.1.8.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée ASpipe avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
AStuyau
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DESCRIPTION
ASpipe est un pipeline pour traiter les alignements GeneSeqer/GMAP et identifier les événements d'épissage alternatif (AS) à partir des alignements. Il nécessite unix bash, perl 5.0+ avec module DBI et MySQL5.0+ pour fonctionner correctement.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Perl
Environnement de base de données
Perl DBI/DBD, MySQL
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/aspipe/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.