Il s'agit de l'application Linux GenoCline, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom GenoCline-1.5.zip. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée GenoCline avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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GenoCline
DESCRIPTION
Identification des clines à partir de la fréquence des allèles ou des bases de données pangénomiques. Transformation angulaire. Fonction sigmoïde.
Paramétrage d'un cline : orientation, coefficient de corrélation produit-moment de Pearson, régression linéaire et sigmoïde et coefficient de détermination. Représentation graphique du cline. Limites de confiance.
Autocorrélation spatiale. L'indice de Moran.
Isolement par la distance. Régression exponentielle. Corrélation Fst/Distance.
Méthode centroïde.
Hétérozygotie attendue par rapport à l'hétérozygotie prédite de Cline.
MDS. Projection de Sammon.
Distances géographiques. Premières distances.
Exportez les données vers Arlequin, Phylip, Past et Poptree.
Données d'entrée conviviales.
Comment ça marche
- Identification des clines à partir de la fréquence des allèles ou des bases de données pangénomiques. Transformation angulaire. Fonction sigmoïde.
- Paramétrisation d'un cline : orientation, coefficient de corrélation produit-moment de Pearson, régression linéaire et sigmoïde et coefficient de détermination.
- Représentation graphique du cline. Limites de confiance.
- Autocorrélation spatiale. Indice de Moran. Isolement par la distance. Régression exponentielle. Corrélation Fst/Distance. Méthode du centroïde. Hétérozygotie attendue et prédite de Cline. MDS. Projection de Sammon. Distances géographiques. Distances Fst.
- Exportez les données vers Arlequin, Phylip, Past et Poptree.
- Données d'entrée conviviales.
Audience
Science/Recherche, Éducation
Interface utilisateur
Balançoire Java
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/genocline/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
