Il s'agit de l'application Linux MANTIS R Package, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom MANTIS_3.3.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez gratuitement en ligne cette application nommée MANTIS R Package avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Forfait MANTIS R
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DESCRIPTION
Ce référentiel contient la version de code la plus mise à jour de MANTIS, le package R Multi-locus ANTIgenic Simulator.
MANTIS est développé et maintenu par le groupe de recherche Evolutionary Ecology of Infectious Disease (EEID) du Department of Zoology, University of Oxford, UK.
Pour des informations théoriques, veuillez vous référer à « MANTIS : un package R qui simule des modèles multilocus d'évolution des agents pathogènes » (https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0598-9 ACCÈS OUVERT)
Pour le moment, MANTIS n'est pas disponible sur CRAN.
Pour construire un package source de MANTIS, utilisez le script buildPackage.R
Pour installer MANTIS, utilisez 'install.packages(file.tar.gz,type="src",repo=NULL)'
Pour tester, utilisez test_V3.3_code.R
Contactez l'auteur principal de la publication ci-dessus pour plus de détails.
Amusez-vous!
Audience
Science/Recherche, Éducation
Langage de programmation
B / R
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mantis-r-package/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
