डेन - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

डैन - न्यूक्लिक एसिड पिघलने के तापमान की गणना करता है

SYNOPSIS

सज्जन -अनुक्रम Seqall -खिड़की का आकार पूर्णांक -शिफ्टइंक्रीमेंट पूर्णांक -डनाकोन्को नाव
-साल्टकॉन्सी नाव [-उत्पाद टॉगल] -फॉर्मामाइड नाव बेमेल नाव -प्रोडलेन पूर्णांक
[-थर्मो टॉगल] -तापमान नाव -आरएनए बूलियन -कथानक टॉगल -mintemp नाव
-ग्राफ xygraph -आउटफाइल रिपोर्ट

सज्जन -मदद

वर्णन

सज्जन EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन सॉफ्टवेयर"
सुइट")। यह "न्यूक्लिक: गुण, न्यूक्लिक: संरचना" कमांड समूह का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-अनुक्रम Seqall

अपेक्षित अनुभाग
-खिड़की का आकार पूर्णांक
पिघलने बिंदु और अनुक्रम के अन्य थर्मोडायनामिक गुणों के मान हैं
अनुक्रम की एक छोटी लंबाई जिसे विंडो के रूप में जाना जाता है और निर्धारित करके निर्धारित किया जाता है
उस विंडो में अनुक्रम के गुण। विंडो को धीरे-धीरे साथ ले जाया जाता है
प्रत्येक नई स्थिति में गुणों की गणना के साथ अनुक्रम। डिफ़ॉल्ट मान: 20

-शिफ्टइंक्रीमेंट पूर्णांक
यह वह राशि है जिसके द्वारा विंडो को खोजने के लिए प्रत्येक वृद्धि पर स्थानांतरित किया जाता है
पिघलने बिंदु और अनुक्रम के साथ अन्य गुण। डिफ़ॉल्ट मान: 1

-डनाकोन्को नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 50.

-साल्टकॉन्सी नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 50.

अतिरिक्त अनुभाग
एस्ट्रो मॉल विकल्पों
-उत्पाद टॉगल
यह प्रतिशत फॉर्मामाइड, अनुमत बेमेल प्रतिशत और उत्पाद की लंबाई के लिए संकेत देता है।

-फॉर्मामाइड नाव
यह गणना में उपयोग किए जाने वाले प्रतिशत फॉर्मामाइड को निर्दिष्ट करता है (इसे तब तक नजरअंदाज किया जाता है)।
-उत्पाद का उपयोग किया जाता है)। डिफ़ॉल्ट मान: 0.

बेमेल नाव
यह गणना में उपयोग किए जाने वाले प्रतिशत बेमेल को निर्दिष्ट करता है (इसे तब तक अनदेखा किया जाता है)।
-उत्पाद का उपयोग किया जाता है)। डिफ़ॉल्ट मान: 0.

-प्रोडलेन पूर्णांक
यह गणना में उपयोग की जाने वाली उत्पाद की लंबाई निर्दिष्ट करता है (जब तक इसे अनदेखा नहीं किया जाता)।
-उत्पाद का उपयोग किया जाता है)। डिफ़ॉल्ट मान: $(विंडो का आकार)

thermodynamic विकल्पों
-थर्मो टॉगल
आउटपुट डेटा में अनुक्रम विंडो के DeltaG, DeltaH और DeltaS मानों को आउटपुट करें
फ़ाइल.

-तापमान नाव
यदि -थर्मो निर्दिष्ट किया गया है तो यह उस तापमान को निर्दिष्ट करता है जिस पर जाना है
DeltaG, DeltaH और DeltaS मानों की गणना करें। डिफ़ॉल्ट मान: 25.

उन्नत अनुभाग
-आरएनए बूलियन
यह निर्दिष्ट करता है कि अनुक्रम एक आरएनए अनुक्रम है न कि डीएनए अनुक्रम।

उत्पादन अनुभाग
-कथानक टॉगल
यदि यह निर्दिष्ट नहीं है तो आउटपुट डेटा की फ़ाइल तैयार की जाती है, अन्यथा इसका एक प्लॉट तैयार किया जाता है
अनुक्रम के साथ गलनांक उत्पन्न होता है।

-mintemp नाव
प्लॉट के तापमान पैमाने (y-अक्ष) के लिए न्यूनतम मान दर्ज करें। डिफ़ॉल्ट मान:
55.

-ग्राफ xygraph

-आउटफाइल रिपोर्ट
यदि कोई प्लॉट तैयार नहीं किया जा रहा है तो प्रत्येक विंडो में गलनांक आदि पर डेटा
अनुक्रम के साथ फ़ाइल में आउटपुट होता है।

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके डेन का ऑनलाइन उपयोग करें