Ini adalah perintah bp_download_query_genbankp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bp_download_query_genbank - skrip untuk menanyakan Genbank dan mengambil catatan
PENGGUNAAN
bp_download_query_genbank --query "Neurospora[ORGN]" --db nucest -o Ncrassa_ESTs.fa --format fasta
bp_download_query_genbank --queryfile 'filewithquery' --db nucest -o Ncrassa_ESTs.fa --format fasta
Lainnya Pilihan
Berikan SATU dari:
-q --query kueri string ATAU
--queryfile file profil dengan kueri ATAU
--gi --gis --gifile file dengan daftar GI untuk diunduh
Jenis basis data:
-d --db database (nukleotida [default], inti, protein, )
-o --out --outfile file output (hasil ditampilkan di layar jika tidak)
-f --format format output file urutan (fasta secara default)
-v --keluaran debug verbose
Pertanyaan Pilihan
--maxids jumlah maksimum ID untuk diambil dalam satu set (100 sekaligus secara default)
--tanggal
--maxdate maxdate untuk catatan
--mindate tanggal minimum untuk dicatat
--datetype edat atau mdat (dimasukkan atau diubah)
PENULIS Jason Stajichu
Jason Stajich, jason-AT-bioperl.org
Gunakan bp_download_query_genbankp online menggunakan layanan onworks.net
