Ini adalah command coverageCount yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows, atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
coverageCount - menghitung cakupan bacaan yang dipetakan di setiap lokasi secara keseluruhan
genom referensi
DESKRIPSI
coverageCount Versi 1.5.0-p1
Program ini menghitung cakupan bacaan yang dipetakan di setiap lokasi di
genom referensi. Ini menghasilkan file biner untuk setiap kromosom dengan menggabungkan
tingkat cakupan sebagai angka integer 4-byte.
penggunaan
coverageCount [opsi] -i -o
Argumen yang diperlukan:
-i
Nama file input dalam format SAM atau BAM.
-o
Awalan dari file output. Setiap file keluaran berisi bilangan bulat empat byte
Argumen opsional:
--maksMOp Jumlah maksimum operasi 'M' yang diizinkan dalam string CIGAR.
10 secara default. Baik 'X' dan '=' diperlakukan sebagai 'M' dan operasi 'M' yang berdekatan adalah
digabungkan dalam string CIGAR.
coverageCount Versi 1.5.0-p1
Program ini menghitung cakupan bacaan yang dipetakan di setiap lokasi di
genom referensi. Ini menghasilkan file biner untuk setiap kromosom dengan menggabungkan
tingkat cakupan sebagai angka integer 4-byte.
penggunaan
coverageCount [opsi] -i -o
Argumen yang diperlukan:
-i
Nama file input dalam format SAM atau BAM.
-o
Awalan dari file output. Setiap file keluaran berisi bilangan bulat empat byte
Argumen opsional:
--maksMOp Jumlah maksimum operasi 'M' yang diizinkan dalam string CIGAR.
10 secara default. Baik 'X' dan '=' diperlakukan sebagai 'M' dan operasi 'M' yang berdekatan adalah
digabungkan dalam string CIGAR.
Gunakan coverageCount online menggunakan layanan onworks.net
