Ini adalah perintah coverageCount yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
coverageCount - menghitung cakupan pembacaan yang dipetakan di setiap lokasi di seluruh
genom referensi
DESKRIPSI
coverageCount Versi 1.5.0-p1
Program ini menghitung cakupan pembacaan yang dipetakan di setiap lokasi di
genom referensi. Ini menghasilkan berkas biner untuk setiap kromosom dengan menggabungkan
tingkat cakupan sebagai angka integer 4-byte.
penggunaan
coverageCount [opsi] -i -o
Argumen yang diperlukan:
-i
Nama berkas masukan dalam format SAM atau BAM.
-o
Awalan berkas keluaran. Setiap berkas keluaran berisi bilangan bulat empat-byte.
Argumen opsional:
--maksMOp Jumlah maksimum operasi 'M' yang diizinkan dalam string CIGAR.
10 secara default. Baik 'X' dan '=' diperlakukan sebagai 'M' dan operasi 'M' yang berdekatan diperlakukan sebagai 'M'.
digabung dalam string CIGAR.
coverageCount Versi 1.5.0-p1
Program ini menghitung cakupan pembacaan yang dipetakan di setiap lokasi di
genom referensi. Ini menghasilkan berkas biner untuk setiap kromosom dengan menggabungkan
tingkat cakupan sebagai angka integer 4-byte.
penggunaan
coverageCount [opsi] -i -o
Argumen yang diperlukan:
-i
Nama berkas masukan dalam format SAM atau BAM.
-o
Awalan berkas keluaran. Setiap berkas keluaran berisi bilangan bulat empat-byte.
Argumen opsional:
--maksMOp Jumlah maksimum operasi 'M' yang diizinkan dalam string CIGAR.
10 secara default. Baik 'X' dan '=' diperlakukan sebagai 'M' dan operasi 'M' yang berdekatan diperlakukan sebagai 'M'.
digabung dalam string CIGAR.
Gunakan coverageCount online menggunakan layanan onworks.net
