Ini adalah perintah gt-matchtool yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
gt-matchtool - Mengurai format kecocokan dan/atau memanggil alat yang cocok.
RINGKASAN
gt alat korek api [pilihan ...]
DESKRIPSI
-Jenis [...]
pilih format file yang cocok: OPENMATCH: Buka pertandingan format, misalnya vmatch BLASTOUT : tabular
Keluaran BLAST (-m 8) BLASTALLP: panggil BLASTALL dengan blastp BLASTALLN: panggil BLASTALL
dengan blastn BLASTP : panggil blastp BLASTN : panggil blastn LAST : panggil LAST SW : gunakan
Smith-Waterman (standar: OPENMATCH)
-file pertandingan [nama file]
atur nama file input (default: tidak ditentukan)
-db [nama file]
atur nama file database (default: tidak terdefinisi)
-berenang [nilai]
atur panjang pelurusan minimum yang diperlukan (untuk penyelarasan Smith-Waterman) (default: 10)
-swmaxedist [nilai]
atur jarak edit maksimum yang diizinkan (untuk penyelarasan Smith-Waterman) (default: 0)
-pertanyaan [nama file]
atur nama file kueri (default: tidak ditentukan)
-bantu
tampilkan bantuan dan keluar
-versi
tampilkan informasi versi dan keluar
PELAPORAN BUG
Laporkan bug ke[email dilindungi]>.
Gunakan gt-matchtool online menggunakan layanan onworks.net