Ini adalah perintah kmc_tools yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
kmc_tools - operasi tambahan pada database k-mer
RINGKASAN
kmc_tools [parameter global] [parameter operasi]
DESKRIPSI
Perintah ini dan berbagai subkomentarnya menerapkan sejumlah operasi pada KMC
database.
k-mers set operasi untuk 2 KMC database
memotong
persimpangan 2 k-mers set
kmers_kurangi
pengurangan 2 set k-mers
counter_subtract
kontra pengurangan dari 2 set k-mer
serikat
gabungan dari 2 set k-mers
operasi untuk tunggal KMC Database
jenis
mengurutkan k-mers dari database yang dihasilkan oleh KMC2.x
menurunkan
mengecualikan k-mers yang terlalu jarang dan terlalu sering
padat
hapus penghitung (hanya simpan k-mers)
histogram
histogram kejadian k-mers
membuang
membuang k-mers dan counter ke file teks
lebih kompleks operasi:
kompleks
operasi kompleks dengan sejumlah database input
Lainnya operasi:
menyaring
menyaring bacaan dengan jumlah k-mers yang terlalu kecil
PILIHAN
global parameter:
-T
jumlah total utas (default: jumlah inti CPU)
-v
aktifkan mode verbose (menampilkan beberapa informasi) (default: false)
-hp
sembunyikan kemajuan persentase (default: false)
CONTOH
kmc_tools serikat db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
Gunakan kmc_tools online menggunakan layanan onworks.net
