Ini adalah alat picard perintah yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
picard-tools - memanipulasi file SAM dan BAM
RINGKASAN
alat-picard COMMAND [PILIHAN] ...
DESKRIPSI
Format SAM (Sequence Alignment/Map) adalah format umum untuk menyimpan nukleotida besar
keselarasan urutan.
Picard Tools menyertakan utilitas ini untuk memanipulasi file SAM dan BAM:
Tambahkan Atau Ganti ReadGroups
BamToBfq
Statistik BamIndex
BangunBamIndex
HitungHsMetrics
BersihSam
CollectAlignmentRingkasanMetrik
KumpulkanGcBiasMetrics
KumpulkanInsertSizeMetrics
Kumpulkan BeberapaMetrik
KumpulkanTargetedPcrMetrics
KumpulkanRnaSeqMetrics
BandingkanSAM
Buat Kamus Urutan
Contoh BawahSam
EkstrakIlluminaBarcodes
PerkirakanKompleksitasPerpustakaan
CepatqToSam
FilterSamBacaan
Perbaiki Informasi Mate
IlluminaBasecallsToFastq
IlluminaBasecallsToSam
Periksa Direktori Illumina
Alat Daftar Interval
Tandai Duplikat
BerartiKualitasDenganSiklus
GabungkanBamAlignment
GabungkanSamFiles
GabungkanVcfs
NormalisasiFasta
EkstrakSequences
Distribusi Skor Kualitas
Susun UlangSam
Ganti SamHeader
KembalikanSam
Konverter SamFormat
SamToFastq
UrutkanSam
VcfFormatConverter
PisahkanVcfs
ValidasiSamFile
LihatSam
PELAPORAN BUG
[email dilindungi]
HAK CIPTA
Hak Cipta 2010 The Broad Institute
Gunakan alat-picard online menggunakan layanan onworks.net
