Ini adalah perintah vcf-phased-join yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
vcf-phased-join - ambil beberapa potongan pra-fase yang tumpang tindih dan gabungkan menjadi
satu VCF
RINGKASAN
vcf-bertahap-bergabung [PILIHAN] A.vcf B.vcf C.vcf
DESKRIPSI
Tentang: Skrip mengambil beberapa potongan pra-tahap yang tumpang tindih dan menggabungkannya menjadi
satu VCF
menggunakan panggilan heterozigot dari tumpang tindih untuk menentukan fase yang benar.
PILIHAN
-j, --min-join-kualitas
Ambang batas kualitas untuk menempelkan blok pra-tahap bersama-sama [10]
-l, --Daftar
Daftar VCF untuk bergabung.
-o, --keluaran
Nama file keluaran. Ketika "-" diberikan, STDOUT dan STDERR akan digunakan
-q, --min-PQ
Hancurkan segmen pra-fase jika nilai PQ lebih rendah pada input VCF [0.6]
-h, -?, --membantu
Pesan bantuan ini
Gunakan vcf-phased-join online menggunakan layanan onworks.net
