Ini adalah aplikasi Linux bernama QUAST yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai quast-5.0.2.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama QUAST dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
QUAST
DESKRIPSI
QUAST melakukan evaluasi kualitas dan perbandingan rakitan genom yang cepat dan nyaman.
QUAST menghitung sejumlah metrik terkenal, termasuk akurasi contig, jumlah gen yang ditemukan, N50, dan lainnya, serta memperkenalkan yang baru, seperti NA50 (lihat detail di makalah dan manual). Analisis komprehensif menghasilkan tabel ringkasan (dalam format teks biasa, tab-separated dan LaTeX) dan plot warna-warni. Alat ini juga menghasilkan laporan berbasis web yang memadatkan semua informasi dalam satu file yang mudah dinavigasi.
QUAST memiliki antarmuka baris perintah yang intuitif dan manual terperinci untuk membantu pengguna menjalankannya dan memahami hasilnya. Selanjutnya, Lab memulai versi Beta web-QUAST di http://quast.bioinf.spbau.ru/ yang membuat evaluasi kualitas menjadi lebih sederhana.
Makalah QUAST dan MetaQUAST (ekstensi untuk rakitan metagenomik) diterbitkan di Bioinformatika.
Fitur
- laporan berbasis web, tabel dalam format txt biasa, dipisahkan tab, dan LaTeX
- plot warna-warni dan histogram
- evaluasi kualitas dengan dan tanpa genom referensi
- evaluasi kualitas rakitan metagenomik
- browser tambahan interaktif
Para penonton
Sains/Penelitian, Pengembang, Pengguna Akhir/Desktop
User interface
Berbasis web, Baris perintah
Bahasa Pemrograman
Piton, JavaScript
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/quast/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
