dbgeturle - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

dbgeturl: recupera collegamenti a voci di database per un database denominato, tipo di dati e dati
identificatore

SINOSSI

dbgeturl -Banca dati stringa -tipo di dati stringa -identificatore stringa [-file di uscita file di uscita]

dbgeturl -Aiuto

DESCRIZIONE

dbgeturl è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Utils:Misc".

VERSIONI

Ingresso pagina
-Banca dati stringa
Questo è il nome di un database dal catalogo dei database pubblici in EMBOSS
file di dati DRCAT.dat. Se non sei sicuro dei database disponibili, usa dbfind. Se tu
avere un nome di database ma non sei sicuro che sia valido, usa isdbname.

-tipo di dati stringa
Questo è il nome di un tipo di dati recuperabile dal catalogo dei database pubblici in
il file di dati EMBOSS DRCAT.dat. I nomi sono termini del ramo "dati" dell'EDAM
ontologia, http://edamontology.sourceforge.net/. Se non sei sicuro della disponibilità
tipi di dati recuperabili per un determinato database, utilizzare dbtellquery. Se hai un tipo di dati
name ma non sei sicuro che sia valido, usa isdbdata.

-identificatore stringa
Questo è un identificatore di dati (ad esempio un numero di accesso alla sequenza) che viene utilizzato per specificare
i dati (di tipo 'datatype') da recuperare. Se non sei sicuro degli identificatori dei dati
utilizzati per una determinata query (database/tipo di dati) utilizzano dbtellquery. I tipi di dati
gli identificatori sono elencati sotto il ramo "Identificatore dati" dell'ontologia EDAM
(http://edamontology.sourceforge.net/). Per i valori di esempio, vedere il catalogo di
banche dati pubbliche nel file di dati EMBOSS DRCAT.dat. Se disponi di un identificatore di dati ma
non sei sicuro del suo tipo, usa idtell.

Obbligatorio pagina
aggiuntivo pagina
Tecnologia pagina
Uscita pagina
-file di uscita file di uscita
Valore predefinito: stdout

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