Questo è il comando gt-matchtool che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gt-matchtool - Analizza i formati di corrispondenza e/o richiama gli strumenti di corrispondenza.
SINOSSI
gt fiammifero [opzione ...]
DESCRIZIONE
-Type [...]
scegli il formato del file di corrispondenza: OPENMATCH: aprire stile formato, ad esempio vmatch BLASTOUT : tabular
Uscita BLAST (-m 8) BLASTALLP: invoca BLASTALL con blastp BLASTALLN: richiama BLASTALL
con blastn BLASTP : invoca blastp BLASTN : invoca blastn LAST : invoca LAST SW : usa
Smith-Waterman (predefinito: OPENMATCH)
-file di corrispondenza [Nome del file]
imposta il nome del file di input (predefinito: non definito)
-Db [Nome del file]
imposta il nome del file del database (predefinito: non definito)
-swminlen [APPREZZIAMO]
impostare la lunghezza di allineamento minima richiesta (per l'allineamento Smith-Waterman) (predefinito: 10)
-swmaxedist [APPREZZIAMO]
imposta la distanza di modifica massima consentita (per l'allineamento Smith-Waterman) (predefinito: 0)
-interrogazione [Nome del file]
imposta il nome del file di query (predefinito: non definito)
-Aiuto
visualizza la guida ed esci
-versione
visualizza le informazioni sulla versione ed esci
REPORTING BUG
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