Questo è il comando gt che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gt - Il sistema di analisi del genoma GenomeTools.
SINOSSI
gt [opzione ...] [strumento | copione] [argomento ...]
DESCRIZIONE
-i [si|no]
entra in modalità interattiva dopo l'esecuzione or copione
-q [si|no]
sopprimere gli avvisi
-Test [si|no]
eseguire test unitari ed uscire
semi [APPREZZIAMO]
impostare manualmente il seme per il generatore di numeri casuali. 0 genera un seme dall'ora corrente
e ID processo
-Aiuto
visualizza la guida ed esci
-versione
visualizza le informazioni sulla versione ed esci
Strumenti:
· letto_a_gff3
· cds
· catena2dim
· chseqid
· cavedano
· comprende
· condensaq
· congruenza
· convertiseq
· CSA
· punto
· dupfeat
· allegato
· enseq2spm
· eval
· estrazione
· estrarreseq
· fastq_campione
· indice delle caratteristiche
· impronta
· genomediff
· GFF3
· gff3_to_gtf
· validatore gff3
· gtf_to_gff3
· luppolo
· id_to_md5
· inlineseq_add
· inlineseq_split
· interazione
· serratura
· ltrclustering
· ldigest
· ltrraccolto
· fiammifero
· matstat
· md5_to_id
· unire
· mergefeat
· mgt
· mkfeatureindex
· mkfmindex
· mmaandread
· osservatore
· indiceimballato
· prebwt
· readjoiner
· ritrovare
· scriptfilter
· seme_estendere
· select
· ss
· seqfiltro
· seqid
· seqmutato
· seqorder
· seqstat
· seqtransform
· seqtranslate
· sequenziale
· distruttore di documenti
· shulongist
· simread
· sketch
· pagina_disegno
· cecchino
· granello
· splicesiteinfo
· divisa
· stat
· suffisso
· tagerator
· talmero
· tirvisco
· uniq
· uniquesub
· wtree
Imposta la variabile d'ambiente GT_MEM_BOOKKEEPING=on per abilitare la contabilità della memoria (ad esempio,
in questo modo: env GT_MEM_BOOKKEEPING=on gt).
Imposta la variabile d'ambiente GT_ENV_OPTIONS=-spacepeak per mostrare uno spacepeak dopo il programma
correre. Imposta la variabile di ambiente GT_ENV_OPTIONS=-showtime per mostrare i tempi di elaborazione per
alcune parti del programma se implementate.
Imposta la variabile d'ambiente GT_SEED su un valore intero per fornire un seme per il casuale
generatore di numeri. Può essere sovrascritto dall'opzione -seed.
Sono possibili combinazioni. L'esecuzione del binario gt con GT_ENV_OPTIONS=-help mostra tutto
possibili "opzioni ambientali".
REPORTING BUG
Segnala bug a[email protected]>.
Utilizza gt online utilizzando i servizi onworks.net
