זוהי הפקודה cmtk-epiunwarp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
epiunwarp - תמונות מישוריות של Echo Unwarp
תַקצִיר
אפיון-עיוות קלטתמונה1 קלטתמונה2 פלטתמונה1 פלטתמונה2 פלטשדהפלטשדהסיבוב
תיאור
תיקון עיוות הנגרם על ידי אי-הומוגניות של שדה B0 בתמונות Echo Planar (למשל, דיפוזיה-
תמונות משוקללות) באמצעות שתי תמונות שנרכשו עם כיווני קידוד פאזה מנוגדים.
אפשרויות
גלוֹבָּלִי ארגז כלים אפשרויות (אלה יש לו משותף by את כל CMTK כלים)
- עזרה
כתוב רשימה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות לפלט סטנדרטי.
--לעזור לכולם
כתוב רשימה מלאה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות ומתקדמות לפלט סטנדרטי.
--וויקי
כתוב רשימה של אפשרויות שורת הפקודה לפלט סטנדרטי בסימון MediaWiki.
--איש
כתוב מקור דף אדם בסימון 'nroff' לפלט סטנדרטי.
--גִרְסָה
כתוב גרסת ערכת כלים לפלט סטנדרטי.
--הֵד
כתוב את שורת הפקודה הנוכחית לפלט סטנדרטי.
--רמת מילולית
הגדר את רמת הדיבור.
--מִלוּלִי, -v
הגדל את רמת המילוליות ב-1 (הוצא משימוש; נתמך עבור תאימות לאחור).
--חוטים
הגדר את המספר המרבי של שרשורים מקבילים (עבור שרשורי POSIX ו-OpenMP).
קֶלֶט תמונה פרמטרים
--קידוד-פאזה
הגדר את כיוון הקואורדינטות של התמונה המקודדת בפאזה. ערכים נתמכים: "phase-
"encode-ap", "phase-encode-is", "phase-encode-lr", כאשר ברירת המחדל היא "phase-encode-"
ap", או השתמש באחת מהאפשרויות הבאות:
--phase-encode-ap, -y
קידוד פאזה קדמית/אחורית (זהו המקרה הנפוץ ביותר) [זֶה is מה היא
בְּרִירַת מֶחדָל]
--פאזה-קידוד-הוא, -z
קידוד פאזה עליונה/תחתונה (זה נדיר)
--phase-encode-lr, -x
קידוד פאזה רוחבי, שמאל/ימין (זה נדיר ביותר)
--ללא היפוך
השתמש במתג זה כדי שלא יהיה צורך להפוך את התמונה המקודדת בפאזה הפוכה לפני כן.
לביטול עיוות. אם תמונה מקודדת בפאזה רגילה ובפאזה הפוכה מוצגת באותו גובה-רוחב
כיוון ב'טריפלנר', אז היפוך אינו הכרחי וחייב להיות כבוי
באמצעות מתג זה.
אופטימיזציה פרמטרים
--no-init-shift-com
בטל אתחול ביטול העיוות על ידי הזזת כל שורה כדי ליישר את מרכזי המסה
של רכישה קדימה ואחורה. במקום זאת, השתמשו בשדה דפורמציה התחלתי אפס לחלוטין.
--smooth-sigma-max
רוחב ליבת החלקת תמונה מקסימלי עבור הרמה הגסה ביותר של חישוב רב-סקאלי.
[בְּרִירַת מֶחדָל: 8]
--חלק-סיגמא-דקה
רוחב ליבת החלקת תמונה מינימלי עבור הרמה הטובה ביותר של חישוב רב-ממדיים (0 =
ללא החלקה; קנה מידה של התמונה המקורית). [בְּרִירַת מֶחדָל: 0]
--חלק-סיגמא-הבדל
ההבדל בין רוחב ליבת החלקת תמונה בין שתי רמות עוקבות של
חישוב רב-קנה מידה. [בְּרִירַת מֶחדָל: 0.25]
--משקל-אילוץ-חלקות
גורם משקל עבור איבר אילוץ החלקות מסדר שני בעלות אי-העיוות
פונקציה. [בְּרִירַת מֶחדָל: 0]
--משקל-אילוץ-קיפול
גורם משקל עבור איבר האילוץ למניעת קיפול בעלות ביטול העיוות
פונקציה. [בְּרִירַת מֶחדָל: 0]
--איטרציות , -i
מספר איטרציות אופטימיזציה של L-BFGS (לכל רמה רב-סקלית). [בְּרִירַת מֶחדָל: 10]
תְפוּקָה אפשרויות
--write-jacobian-fwd
כתוב מפת תיקון עוצמה יעקבית עבור תמונה קדמית. [בְּרִירַת מֶחדָל: אף אחד]
--write-jacobian-rev
כתוב מפת תיקון עוצמה ג'ייקוביאנית עבור תמונה בקידוד הפוך. [בְּרִירַת מֶחדָל: אף אחד]
מחברים
טורסטן רוהלפינג, עם תרומות ממייקל פ. האסק, גרג ג'פריס, קלווין ר.
מאורר, דניאל ב' רוסקוף וירוסלב הלצ'נקו
השתמש ב-cmtk-epiunwarp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
