זוהי הפקודה fdnaparse שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fdnapars - אלגוריתם פרסימונית DNA
תַקצִיר
fdnapars -סדר פעולות seqsetall - אינטפילי עץ [משקולות נכסים] [-maxtrees מספר שלם]
-יְסוֹדִי לְמַתֵג -לסדר מחדש בוליאני [-התרה בוליאני] -לבלבל מספר שלם
-זֶרַע מספר שלם [-מחוץ מספר שלם] [-לָדוּשׁ לְמַתֵג] -מפתן לצוף
-תיק אוסף [-פוֹרֶל לְמַתֵג] -outtreefile אוסף [-נתוני הדפסה בוליאני]
[-התקדמות בוליאני] [- תיבת צעדים בוליאני] [-ancseq בוליאני] [-טביעת עץ בוליאני]
-דוטדיף בוליאני
fdnapars עזרה
תיאור
fdnapars היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "פילוגניה:רצף מולקולרי".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות seqsetall
קובץ המכיל יישור רצף אחד או יותר
- אינטפילי עץ
משקולות נכסים
נוסף סעיף
-maxtrees מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 10000
-יְסוֹדִי לְמַתֵג
ערך ברירת מחדל: Y
-לסדר מחדש בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
-התרה בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-לבלבל מספר שלם
-זֶרַע מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1
-מחוץ מספר שלם
-לָדוּשׁ לְמַתֵג
ערך ברירת מחדל: N
-מפתן לצוף
ערך ברירת מחדל: 1.0
תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף
-פוֹרֶל לְמַתֵג
ערך ברירת מחדל: Y
-outtreefile אוסף
-נתוני הדפסה בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-התקדמות בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
- תיבת צעדים בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-ancseq בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-טביעת עץ בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
-דוטדיף בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
השתמש ב-fdnaparse באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
