זהו הפקודה gt-matchtool שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
gt-matchtool - ניתוח פורמטים של התאמה ו/או הפעלת כלי התאמה.
תַקצִיר
gt כלי משחק [אפשרות...]
תיאור
סוג [...]
בחר התאמה בפורמט קובץ: OPENMATCH: לפתוח להתאים פורמט, למשל vmatch BLASTOUT : טבלאי
פלט BLAST (-m 8) BLASTALLP: הפעל את BLASTALL עם blastp BLASTALLN: הפעל את BLASTALL
עם blastn : invoke blastp BLASTN : invoke blastn
סמית'-ווטרמן (ברירת מחדל: OPENMATCH)
-matchfile [שם הקובץ]
הגדר שם קובץ קלט (ברירת מחדל: לא מוגדר)
-db [שם הקובץ]
הגדר את שם קובץ מסד הנתונים (ברירת מחדל: לא מוגדר)
-סוומינלן [ערך]
הגדר אורך יישור מינימלי נדרש (עבור יישור Smith-Waterman) (ברירת מחדל: 10)
-swmaxedist [ערך]
הגדר מרחק עריכה מקסימלי מותר (עבור יישור סמית'-ווטרמן) (ברירת מחדל: 0)
-שאילתא [שם הקובץ]
הגדר שם קובץ שאילתה (ברירת מחדל: לא מוגדר)
עזרה
הצג עזרה וצא
-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת
דיווח באגים
דווח על באגים ל[מוגן בדוא"ל]>.
השתמש ב-gt-matchtool באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net