kmc_tools-counters_subtract - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

kmc_tools-counters_subtract - חישוב מונים חיסור של שני מסדי נתונים של KMC

תַקצִיר

kmc_tools מונים_חסר <output
[output_params]>

תיאור

מסד הנתונים הפלט יכיל רק k-mers שנמצאים בערכת הקלט הראשונה ו
יש מונים גבוהים מה-k-mers המתאימים בסט השני. עבור כל ק-מר ה
מונה שווה להפרש בין המונה בקבוצה הראשונה לבין המונה ב
הסט השני.

אפשרויות

לכל קלט ישנם פרמטרים נוספים:

-ci
לא לכלול k-mers המתרחשים פחות מ פִּי

-cx
לא לכלול k-mers המתרחשים יותר מ פִּי

עבור פלט ישנם פרמטרים נוספים:

-ci
לא לכלול k-mers המתרחשים פחות מ פִּי

-cx
לא לכלול k-mers המתרחשים יותר מ פִּי

-cs
ערך מקסימלי של מונה

דוגמא

kmc - k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract

השתמש ב-kmc_tools-counters_subtract באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net