זוהי הפקודה mapMers-depth שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
mapMers-depth - דווח על מידע על מיפוי kmers לרצפים
תַקצִיר
מפת עומק מרס {-לספור|-עוֹמֶק|-סטטיסטיקות} -מרס מריל -m מרסייז -Seq IN.FASTA
אפשרויות
מצבים of מבצע
עבור המספר הסידורי של הרצף 's' והמיקום ברצף זה 'p':
-לספור מדווח על ספירת הקילומטר (c) של הקילומטר הבודד שמתחיל במיקום (p).
פורמט: 'spc'
-עוֹמֶק מדווח על מספר (n) הקילומטרים המשתרעים על פני מיקום (p).
פורמט: 'spn'
-סטטיסטיקות מדווח על הספירה המינימלית (m), המקסימלית (M) והממוצעת (a) של כל המרים המשתרעים על פני
מיקום (p). מדווח גם על הספירה הכוללת (t) ומספר הקילומטרים (n).
פורמט: 'spm M atn'
כללי
-m מרסייז
-מרס מריל
מריל(1) מסד נתונים
-Seq IN.FASTA
רצף קלט פאסטה
השתמש ב-mapMers-depth באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
