mapMers-depth - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

mapMers-depth - דווח על מידע על מיפוי קמטרים לרצפים

תַקצִיר

mapMers-depth {-לספור|-עוֹמֶק|-סטטיסטיקות} -מרס MERYL -m MERSIZE -Seq IN.FASTA

אפשרויות

מצבים of מבצע
עבור רצף 's' ומיקום ברצף זה 'p':

-לספור מדווח על הספירה (ג) של הקמר היחיד שמתחיל בעמדה (p).

פורמט: 'spc'

-עוֹמֶק מדווח על מספר (n) של ק"מ המשתרע על מיקום (p).

פורמט: 'spn'

-סטטיסטיקות מדווח על ספירת המינימום (m), המקסימום (M) והממוצע (א) של כל ה-mers שמתפרשים על פני
עמדה (p). מדווח גם על ספירה כוללת (t) ומספר ק"מ (n)

פורמט: 'spm M atn'

כללי
-m MERSIZE

-מרס MERYL
מריל(1) מסד נתונים

-Seq IN.FASTA
רצף קלט fasta

השתמש ב-mapMers-depth באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net